应用二代测序技术进行罕见的常染色体隐性遗传性神经系统疾病的分子诊断

来源 :中华医学会2012年医学遗传学年会暨全国第十一次医学遗传学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wyswyswys
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的 在孟德尔遗传的神经系统遗传病中,共济失调毛细血管扩张症(AT)、舞蹈病-棘红细胞增多症(ChAc)、杆状体疾病(NM)、Joubert综合征(JS)等罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病的分子诊断一直以来是应用经典的分子遗传学方法,包括多聚酶链式反应(PCR)和DNA测序(Sanger Sequencing)等.近年来二代测序技术(NGS)发展迅速,因其高通量、高性价比的特点,较传统的测序技术有明显的优势.本研究旨在探讨NGS技术在罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病分子诊断中的应用价值.方法 本研究对6个AT家系和1个ChAc家系的先证者应用目标区域捕获测序技术(TRS)进行测序,对发现的点突变应用Sanger测序进行验证,对发现的拷贝数变异(CNV)应用实时荧光定量PCR(RT-PCR)进行验证;对1个NM家系和1个JS家系的先证者应用外显子组测序(WES)进行测序,对发现的点突变应用Sanger测序进行验证.结果 本研究完成了上述家系的分子诊断,发现了一系列的突变,其中:在AT家系中发现了致病基因ATM的以下复合杂合突变:[c.5697C>A+exon 62-63del]、[c.477_481del ATCTC+c.4777-2A>T]、[c.3078G>T+c.7983_7985delTGT]、[c.72G>A+c.985_989delAGAGG]、[c.5293 C>T+c.1402_1403 delAA]、[c.1402_1403delAA];在ChAc家系中发现了致病基因VPS13A的1个c.9403C>T的已知的纯和突变;在NM家系中发现了致病基因NEB的1个[c.1015 G>A+c.9052G>A]的复合杂合突变;在JS家系中发现了致病基因CC2D2A的1个[c.2999A>T+c.3688C>T]的复合杂合突变.结论 本研究首次提出了应用NGS技术进行罕见的孟德尔遗传的神经系统遗传病分子诊断的概念和策略.首次应用NGS技术完成了多种罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病的分子诊断;证实了NGS技术在诊断罕见的常染色体隐性遗传性神经肌病(特别是具有明显遗传异质性时)中具有明显的优势.
其他文献
Our researches have focused on the discovery and development of novel fluorine-18-substituted positron emission tomography(PET) imaging agents.Efficient methods to provide various fluoro-substituted n
会议
目的 地中海贫血(简称地贫)是一种由于α和β珠蛋白合成比例失衡所导致的严重的致死性遗传病,是世界上最常见的人类常染色体单基因遗传病之一.根据珠蛋白生成障碍的种类分为α地贫和β地贫两大类.东南亚缺失型(--SEA)是一种常见的α突变,主要分布在东南亚地区的泰国,菲律宾,越南和中国南部部分地区.先前的流行病调查显示,我国南方的广西和广东地区--SEA突变的携带率分别为7.84%和4.14%.方法:本课
目的 氧化应激是指机体在遭受各种有害刺激时,体内活性分子如活性氧自由基(reactive oxygen species,ROS)和活性氮自由基(reactive nitrogen species,RNS)产生过多,氧化程度超出氧化物的清除,从而导致组织损伤;已有研究显示氧化应激能够干扰胚胎的发育,引起多种出生缺陷的发生.然而,组蛋白的甲基化是否是受氧化应激影响而导致出生缺陷尚不清楚.Nuclear
背景与目的 氧化应激状态是指由于机体抗氧化能力减弱,自由基不能及时清除,导致细胞发生氧化损伤.已有报道氧化应激在多种疾病的发生发展中起重要作用.还原型谷胱甘肽(GSH)是机体重要的还原剂,能够直接或间接参与机体抗氧化系统.谷胱甘肽还原酶(GSR)能够将氧化型谷胱甘肽(GSSG)还原为GSH,由此可见GSR蛋白在机体发挥抗氧化作用中至关重要.自然环境下,多种因素均能够诱导机体发生氧化应激,因此,我们
目的 通过精原细胞介导的动物转基因技术制备ANGPTL3表达上调和下调的小鼠模型,探讨该技术在基因水平上调和下调Balb/C和昆明系小鼠体内蛋白表达水平中的应用,建立简易有效的动物转基因技术平台.方法(1)制备和线性化ANGPTL3重组质粒pcDNA3.1-ANGPTL3和小干扰质粒pcDNA6.2-GW/EmGFP-ANGPTL3-miRNA;各取4周龄Balb/C雄性小鼠20只和昆明系(KM)
目的 通过体外构建模拟的肿瘤微环境,探讨在肿瘤微环境下SIL-6R及GP130的过度激活和表达对骨髓间充质干细胞(MSCs)向肿瘤方向转化的影响.方法 采用transwell插入式培养皿结合6孔板构建间接共培养体系来模拟MSCs生长的微环境,将实验分为四组:实验组为MSCs与C6胶质瘤间接共培养组,阳性对照组为常规培养C6胶质瘤细胞组,阴性对照组为MSCs与星型胶质细胞间接共培养组,空白组为常规培
目的 对不同人群的CXCL10基因进行PCR测序,并分析自然选择在CXCL10基因进化过程中所起的作用.方法 采用PCR直接测序技术对所收集的74人进行CXCL10基因(包含所有外显子,内含子,及5和3侧翼区)的序列测定.此74人来自三组不同人群,分别为欧洲人群、非洲人群和亚洲人群.单核苷酸多态性位点(SNPs)采用PolyPhred工具鉴定并通过重扩增验证,同时CXCL 10的单体型通过PHAS
Background Protein kinase B(Akt)plays important roles in regulation of cell growth and survival,but little is known about the AKT3(Protein kinase B γ)function,especially the action of AKT3 on human in
目的 常规的胎儿染色体诊断需要侵入性的胎儿细胞取材,越来越多的研究表明通过采用孕妇外周血游离DNA高通量DNA测序技术检测,可以无创性的进行21三体胎儿检测.最近的研究逐步发展到21,18,13三体和性染色体异倍体无创检测,但迄今为止该方法所检测的染色体异常局限于整条染色体的剂量变化,本研究探讨采用该技术用于胎儿大片段的染色体不平衡无创检测的可能性.方法 两例经羊水染色体G带核型确认的染色体大片段
会议
Liver cancer is the fifth most common cancer in the world and the third most common cause of cancer-related death.Overall,50% to 55% of cases of primary liver cancer are attributable to persistent hep