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目前城镇生活污水处理厂多数采用活性污泥法处理工艺。活性污泥是污水活性污泥处理系统的反应工作主体，污水处理效果的好坏与活性污泥中的微生物种类、数量及其代谢活力有着直接的关系，所以污水处理系统中微生物的状态对污水处理效果具有很好的指示作用。由于不同种类的原生动物对环境条件的要求和对环境的敏感程度不同，所以可以利用原生动物种群的生长情况来判断活性污泥的状况。另外，原生动物体积相比于细菌要大，利用低倍显微镜即可以观察到，因此以原生动物为指示生物在操作上更为方便。因此可以通过对活性污泥中原生生物状态进行监测，在一定程度上掌握污水处理系统运行的情况，及时发现系统环境的变化并调整运行环境，从而预防污水处理系统运行中异常情况的发生。