【摘 要】
：
芋螺毒素是海洋软体动物芋螺产生的一类具有显著神经药理活性的肽类毒素,其合成、转运、分泌均在特化器官毒腺管中完成,本文利用第二代Ilhmina/solexa高通量测序平台,对南海食虫芋螺独特芋螺(Conus caracteristicus)毒腺管进行了转录组测序分析.通过对构建的毒腺管常规转录组文库进行深度测序并进行de novo组装, 得到72,462条unigenes序列,通过与构建的本地毒素库
【机 构】
：
解放军防化研究院,北京 102205 华大基因研究院,广东 深圳 518083
【出 处】
：
第十一届中国生物毒素研究及医药应用年会
论文部分内容阅读
芋螺毒素是海洋软体动物芋螺产生的一类具有显著神经药理活性的肽类毒素,其合成、转运、分泌均在特化器官毒腺管中完成,本文利用第二代Ilhmina/solexa高通量测序平台,对南海食虫芋螺独特芋螺(Conus caracteristicus)毒腺管进行了转录组测序分析.通过对构建的毒腺管常规转录组文库进行深度测序并进行de novo组装, 得到72,462条unigenes序列,通过与构建的本地毒素库比对分析,经同源预测和de novo预测,共得到了118条不同的芋螺毒素序列.发现的毒素序列可被归为12个已知的超家族或类型,大部分毒素属于A-、M-、O-、I-与T-超家族(61％).绝大多数毒素(91.5％)均为首次发现, 这些分属于不同超家族的新毒素序列中含有多种新的半胱氨酸(Cys)骨架类型,另外还发现了一类结构新颖的新毒素基因序列(13条),这类毒素序列中含有特殊的Cys骨架类型(C-C-C-C-C-C),它们的loop区长度和成熟肽序列均与已知毒素差异很大, 可能代表着一类新的毒素超家族.同时,采用RPKM方法对发现的芋螺毒素基因表达量进行统计分析,研究表明M-超家族和O-超家族毒素在独特芋螺毒腺管中具有很高的表达丰度,这两类毒素可能在食虫芋螺捕食进程中起着决定性的作用.
其他文献
两栖类作为首个登陆的物种,在脊椎动物的进化及其免疫系统进化中占有非常关键的位置。然而,目前两栖类基因组信息仅来自非洲爪蟾及其近亲种,这使得两栖类相关研究相对迟缓。基于数年来对分布于我国西南地区典型蛙种—大蹼铃蟾的研究,我们推测大蹼铃蟾可能比其他蛙类(包括对非洲爪蟾)具有更强的免疫系统,例如抗细菌、病毒的感染。因而,我们对大蹼铃蟾转录组进行了比较分析,发现大量高表达的皮肤特异性基因,以及调节性的非编
Acutobin has been isolated from Deinagkistrodon acutus venom and used to prevent or treat stroke for Chinese patients over the last three decades.This 38 kDa α-fibrinogenase contains disialyl-capped c
the present study,we investigated the anti-nociceptive effect and the underlying mechanism of the analgesic-antitumor peptide (AGAP),a neurotoxin from the scorpion Buthus martensii Karsch.AGAP in dose
Potassium channel functions are often deciphered by using selective and potent scorpion toxins.Among these toxins,only a limited subset is capable to selectively block small conductance Ca2+-activated
Recently,peptide drugs have evolved into mainstream therapeutics,representing a significant portion of the pharmaceutical market.However,their bioavailability remains to be improved compared with that
The venoms of many kinds of spiders such as black widow spider (Latrodectus tredecimguttatus) are known to contain a multitude of components toxic to animals and insects.However,it may not be widely k
本研究采用亲水作用色谱-高分辨电喷雾质谱联用技术(HILIC-HR-ESUMS)结合麻痹性贝毒素(PSP)精确质量数数据库，建立快速筛查、定性识别赤潮藻中常见PSP的方法.产毒藻细胞破碎后经0.1 mol/L乙酸水溶液提取，通过HILIC-HR-ESI/MS正负离子模式全扫描分析，得到产毒藻粗提物中PSP化合物准分子离子及主要碎片离子精确质量数，结合PSP数据库筛查并辅以商品化软件数据分析，实现产
2011年5月25日-27日, 我市苍南县暴发了57例因食用紫贻贝(淡菜)引起的腹泻性贝类毒素(diarrhetic shellfish poisoning,DSP)中毒事件,为了掌握紫贻贝的染毒情况,我们对其含有的贝类毒素成分进行分离、鉴定和检测。样品经丙酮提取,提取物经乙醚, 水液分配,乙醚可溶部分再经硅胶柱层析粗分离、反相高效液相色谱半制备细分离,UPLC-MS/MS监测。分离得到4个毒素组
近年人们应用大孔聚合树脂在海洋或淡水环境中富集水体中溶解的藻毒素,对水环境中藻毒素污染状况进行监测和预警,以期达到减免水产养殖经济损失和保护人类健康的目的。目前聚苯乙烯大孔树脂HP20和SP700作为最常用的两种树脂,能够有效地吸附水环境中溶解的腹泻性贝毒、麻痹性贝毒、微囊藻毒素等。本研究以这两种大孔树脂为吸附剂,分别以腹泻性贝毒OA、DTX1毒素,微囊藻毒素MC-LR、[Dha7]-MC-LR为