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桃花水母俗称桃花鱼，属于刺胞动物门、水螅纲、淡水水母目、笠水母科、桃花水母属，是腔肠动物中水母类仅有的淡水种类。目前国内主要依据形态特征对桃花水母进行分类，但其局限性给分类工作带来了一定的困难。本研究对浙江省4个地点的桃花水母ITS区基因进行了克隆和测序，并与已知的桃花水母的ITS序列进行比对，旨在确定浙江省4个地点桃花水母的分类地位。核糖体rRNA基因是高度保守的，其突变积累在线形重复排列的rRNA基因两侧的非编码区，从而使核糖体基因间隔区序列具有种内和种间的特异性，这种变化有助于种下分型和变异研究。同时在ITS区基因两侧保守性很高的18S rRNA和28S rRNA基因使引物设计也比较容易操作。大量的研究表明核糖体rDNA转录内间隔区（ITS）可以应用于属种之间以及亚种水平的鉴别研究。本研究的浙江四地桃花水母，分别是2007年采自宁波象山市郊、2005年采自宁波江北消防池、2008年采自温州平阳以及2008年采集自金华永康上黄水库的桃花水母。通过对ITS区基因序列进行分析，并与GenBank中已有的桃花水母ITS区基因进行比对，发现与索氏桃花水母的同源性都在97％以上，而与其他桃花水母的同源性在50%到80%之间。进一步对遗传距离和进化树分析，发现4地桃花水母与索氏桃花水母的遗传距离保持在0-0.008之间，而与其他桃花水母的遗传距离较远，在0-0.350之间，在进化树中也与索氏桃花水母聚为同一支，从而从分子水平上得出浙江省4个地点桃花水母均属于索氏桃花水母的结论。该结论与对这4个地点桃花水母的形态学分类及18S rRNA基因序列分析结果一致。