【摘 要】
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蛋白质链接(Cα-Cα＜8(A))预测是根据蛋白质序列的比对得到的一个概率图表,常用的方法可以分为三种:机器学习,共同进化和meta方法.用朴素贝叶斯和机器学习方法设计了新的蛋白质链接预测软件NN-BAYES,并且将NN-BAYES整合到蛋白质三维结构预测软件QUARK中.结果显示:NN-BAYES可以将蛋白质链接预测精度提高15％-24％,在将NN-BAYES整合入QUARK之后,QUARK可以
【机 构】
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中国科学院理论物理研究所,北京100190;美国密歇根大学,安娜堡48108 美国密歇根大学,安娜
【出 处】
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“可控自组装体系及其功能化”重大研究计划2015-2016年度学术交流会
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蛋白质链接(Cα-Cα＜8(A))预测是根据蛋白质序列的比对得到的一个概率图表,常用的方法可以分为三种:机器学习,共同进化和meta方法.用朴素贝叶斯和机器学习方法设计了新的蛋白质链接预测软件NN-BAYES,并且将NN-BAYES整合到蛋白质三维结构预测软件QUARK中.结果显示:NN-BAYES可以将蛋白质链接预测精度提高15％-24％,在将NN-BAYES整合入QUARK之后,QUARK可以将简单蛋白质三维结构预测精度提高47.6％,复杂蛋白质结构预测精度提高7％.
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