蛔虫(roundworms)是线虫纲(Nematoda),蛔目(Ascaridida),蛔科(Ascaridoidae)中的一类常见土源性寄生线虫,其成虫寄生于人和动物肠道内,可引起严重的蛔虫病(ascariasis),对全球人和动物健康危害极大.然而由于采样和关注度的偏好性,目前有关蛔虫各种的研究仍局限于一些人畜共患或经济重要的寄生性虫种,如：人蛔虫(Ascaris lumbricoides)、猪蛔虫(Ascaris suum)、单一异尖线虫(Anisakis simplex)和犬弓蛔虫(Toxocara canis)；而对于野生动物(包括人类亲缘最近的非人灵长类)蛔虫的认识和了解却知之甚少.更为重要的是,长期以来围绕非人灵长类蛔虫是人蛔虫还是其它种类蛔虫这一话题,不少寄生虫学者仍各持己见.在此,我们首次测序完成两种非人灵长类代表——黑猩猩(Pantroglodytes)和白颊长臂猿(Hylobates hoolock)——蛔虫(Ascaris spp.)的线粒体全基因组.基因组特征分析表明：1)两蛔虫基因组呈环状,长度分别为14,268bpand 14,274bp,与已报道的人蛔虫mtDNA 大小类似；2)整个基因组编码36 个基因,其中蛋白质编码基因12个,tRNA 基因22个,大、小核糖体亚基(16S 和12S)各一个,无论基因种类还是数量二者与多数已知线虫的mtDNAs 一致.最后,借助比较基因组学、基因组核苷酸全序列一致性分析以及系统进化(NJ、MP、BI)分析,我们的结果强有力地表明：黑猩猩源蛔虫(cA)与白颊长臂猿源蛔虫(gA)属一个种,且二者和人蛔虫享有一致遗传相似性；进一步证实cA 和gA是人蛔虫.该结论与先前的形态学和分子生物学研究结果一致.本研究发现不仅将对人类,特别是非人灵长类饲养员及兽医工作者的公共卫生安全产生极大的意义和影响,而且我们的基因组数据所蕴含的生物学信息也将加深我们对蛔目各物种之间系统进化关系的了解和丰富我们用于野生动物和家养动物蛔虫物种系统进化、种群遗传及进化生物学研究的分子标示库.