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蛋白质构象空间及其动力学的重要性和复杂性广为人知，但其根本驱动力在理论上尚未形成广泛接受的结论。有些构象变化过程被认为是熵驱动的，而另外一些则被认为是焓驱动的。通过对不同球形蛋白质分子大量分子动力学模拟轨迹的分析，我们提出了蛋白质基本构象的定义，并认为在这些典型的蛋白质分子中，所有的构象变化过程可以被认为是熵驱动过程。分子体系的计算历史是以对波尔兹曼分布的直接应用-即对微观态能量的计算为核心展开的。力场的准确性是人们广泛专注的问题，但也许采样方法导致的误差要比我们想象中的更大。