玉米黑粉病菌基因组中的微卫星序列的组成和分布

来源 :中国植物病理学会2004年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sww0310818
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本文利用已经分布的玉米黑粉病菌基因组测序结果,对该真菌基因组中基序为1-6碱基的微卫星(SSR)序列进行了系统地分析.结果表明,在已经分布的19.7Mb的基因组序列中,共有6607个SSR系列(长度大于15bp,匹配值大于80%);其碱基总数为149363bp,占整个基因组缄基数的0.76%,平均3.0kb碱基中就分布有一个大于15bp的SSR序列.其中数量最多为六碱基重复序列,总长度达55806bp,其次为三碱其重复,数量达到38679bp,五碱基重复序列(2545bp).数量最少的是单碱基重复序列,只有6551bp.
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