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为了了解大眼华鳊(S.macrops)在全分布区的居群扩散模式以及了解其几个地理种群以及华鳊属之间的进化关系,我们基于线粒体控制区部分序列对来自于7个水系的大眼华鳊和2个水系的海南华鳊(S.melrosei)以及长江的长臀华鳊(S.longianalis)的遗传结构和亲缘关系进行了研究.结果显示:大眼华鳊珠江、长江、闽浙以及海南华鳊九龙江和珠江的线粒体控制区序列歧异度在3%-8%之间,接近或达到了亚种水平的分化,五个地理区域的华鳊分化明显.系统发生分析显示长江位于各群体的进化关系的中心,指示长江可能是大眼华鳊和海南华鳊的起源中心.珠江大眼华鳊群体遗传多样性极低(h=0.067±0.061,π=0.00007±0.00007),推测为偶然事件外迁入珠江水系,应与珠江分布的海南华鳊进入珠江的过程无关;珠江大眼华鳊与湘江大眼华鳊之间的亲缘关系最近(Da=0.001082),提示珠江大眼华鳊可能通过灵渠从湘江扩散而来.闽浙一带位于一个谱系内,AMOVA分析、遗传分化指数(Fst)以及遗传距离(Da)都提示闽江与各水系间的遗传结构的均一度最高,钱塘江、交溪群体发生分化,扩张时间以及网络结构分析显示该区域内的扩散中心应该是闽江.对闽浙各群体的遗传结构和种群历史分析显示闽江、钱塘江曾先后经历明显的扩张,而其他群体未发生明显的扩张,提示可能是水系规模影响了遗传结构的形成.