拟穴青蟹(Scylla paramamosain)是我国重要的养殖蟹类之一.2008年我国青蟹养殖面积达到3.26万公顷，产量11.38万吨.青蟹养殖业的蓬勃发展对于提高沿海渔民收入，繁荣沿海农村经济发挥了重要的作用.然而我国青蟹养殖业的发展面临着一系列的制约因素，一是优质健康种苗缺乏跟不上产业发展的需求；二是养殖配套技术落后，养殖模式单一严重限制了产业发展速度；三是高效人工饲料研发滞后，缺乏配套投喂技术影响了产业发展规模.本文对课题组近年来在苗种规模化培育和种质资源研究方面的工作进行了综述.在菌种人工繁育方面，简述了当前拟穴青蟹人工繁殖的概况、存在的问题、苗种生产过程中的主要影响因子(包括微生态环境，水质，盐度，温度，光照等)及其应对措施.在遗传育种方面， 利用线粒体和微卫星标记对我国青蟹主要分布区域各地理种群的形态特征和遗传特征进行了分析，为我国青蟹种类的正确命名提供了证据；开展了青蟹品种选育工作，构建了选育的基础群体，以及选育家系；筛选获得了100个多态性高扩增效果好的青蟹微卫星标记及80多个SNP标记；开展了青蟹的功能基因组学研究工作，构建了不同组织的cDNA文库，测序得到近2000个unique基因，并对部分与性腺发育，蜕壳发育相关的功能基因开展了转录水平的表达分析.为筛选优良的青蟹新品种提供了候选基因.