公立医院的绩效考核难在指标设置上，而科学的指标体系有赖于合理设置衡量的维度。医院不同于其他组织机构，它涉及到健康服务的提供。健康本身就非常难以评价，健康机构的服务也是如此。因此，公立医院实施绩效管理就必须处理好“维护公益性”和“调动积极性”之间的关系。 在国家法律法规及有关卫生政策指导下，通过实行（全）成本核算，优化资源配置，充分利用现有资源，最大限度地调动全院各层次职工的工作积极性；通过科室二级分配，使收入分配更适合每个科室／病区的实际情况，更能起到激励和奖惩作用，更能体现多劳多得的分配原则。 要坚持绩效优先，兼顾公平的原则：注重效率和效益，倡导节约，强调优质服务。对贡献度大的职工给予相对较高的报酬。坚持对艰苦、高危、临床一线岗位倾斜，对高、新技术与科研教学给予支持和保护的原则。在二级分配中引入成本核算的概念，遏制人力、物资材料、设备与房屋的不良消耗。绩效工资组成：临床科室（含病房）的绩效工资由各临床科室收支结余、挂号费、出院人次、手术费、护理费等组成，并在此基础上加入了效率考核、医疗质量考核、护理质量考核、医德医风考核、病人满意度考核以及医疗纠纷与投诉考核。大幅度提高了对于医疗务质量考核的权重，成为此次绩效工资改革的根本出发点和最大亮点。