【摘 要】
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目的通过基于靶标三维结构的虚拟筛选方法,发现全新结构的Kv1.5钾通道阻滞剂。方法首先构建Kv1.5钾通道蛋白同源模型,定义Kv1.5钾通道跨膜区结合的S5-P-S6段氨基酸残基为活性
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目的通过基于靶标三维结构的虚拟筛选方法,发现全新结构的Kv1.5钾通道阻滞剂。方法首先构建Kv1.5钾通道蛋白同源模型,定义Kv1.5钾通道跨膜区结合的S5-P-S6段氨基酸残基为活性位点,然后使用DOCK软件,对Maybridge小分子数据库进行虚拟筛选,结合类药性分析手段,寻找先导化合物;最后使用膜片钳电生理方法检测化合物对Kv1.5的阻滞水平。结果通过虚拟筛选和类药性分析,获得的分数排名靠前的化合物18个中,5个化合物对Kv1.5通道有明显的阻滞作用(10μM抑制率大于50%),这5个化合物属于4种新骨架类型。结论通过计算机辅助药物设计与虚拟筛选手段,大大提高了先导化合物的发现效率,可以加快新药研究的步伐。
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