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目的：探讨不同MTHFR、TS基因型对ALL患儿HD-MTX化疗后不良反应的影响,以及与MTX血药浓度变化之间的关系;分析MTHFR、TS基因多态性在个体化治疗及疾病防治中的作用.方法：筛选出ALL患儿73例,提取其基因组DNA,PCR扩增后测序鉴定MTHFR C677T、MTHFR A1298C、TS 5-UTR的基因型.观察所有ALL患儿HD-MTX化疗后的不良反应,并监测MTX血药浓度.所得实验数据均用SPSS13.0软件处理和分析,以Logistic回归分析基因多态性与化疗后不良反应的危险度;采用Fisher精确概率比较HD-MTX化疗后MTHFR C677T、MTHFR A1298C、TS的不同基因型之间4248小时MTX血药浓度的差异,P＜0.05即差异有统计学意义.结果：1.MTHFR677 CC基因型携带者与CT+TT基因型携带者相比,血红蛋白降低的发生风险增加了2.0倍,但差异无统计学意义,未发现MTHFR C677T各基因型与HD-MTX化疗后其它不良反应的发生风险有关联.2.MTHFR1298 AA基因型携带者与AC+CC携带者相比,其黏膜损害发生的风险下降了5.9倍,且差异有统计学意义(OR=0.17,CI: 0.03-0.89).未发现MTHFR A1298C基因多态性与HD-MTX化疗后其他不良反应的发生风险相关.3.TS5-UTR各基因型与HD-MTX化疗后不良反应的发生无关联.4.MTHFR677 CT/TT合并1298 AC/CC基因型者,其血红蛋白降低发生的风险下降了2.9倍,而黏膜损害发生的风险则增加了4.3倍,但差异均无统计学意义.5.MTHFR1298 AC/CC合并TS 3R/3R基因型者,其发生黏膜损害的风险增加了5.4倍,差异有统计学意义(OR=5.41,C/:1.22-24.09).6.MTHFR677 CT/TT合并TS 3R/3R基因型与HD-MTX化疗后不良反应的发生风险无关.7.MTHFR677 CT/TT+MTHFR1298 AC/CC+TS 3R/3R基因型者,其黏膜损害发生的风险增加了7.5倍,且差异有统计学意义(OR=7.50.Cl:1.35-41.72).结论：1.MTHFR C677T、TS基因多态性与ALL患儿HD-MTX化疗后不良反应的发生风险无关.2.MTHFR A1298C与ALL患儿HD-MTX化疗后黏膜损害的发生有关,与其他不良反应(骨髓抑制、肝脏毒性、胃肠道反应)的发生无关.3.TS/和MTHFR C677T基因多态性可增加MTHFR A1298C对ALL患儿HD-MTX化疗后黏膜损害的发生风险.