鸭Mel 1c基因部分cDNA的克隆与生物信息学分析

来源 :中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十四届学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gsy2589
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[目的]为进一步研究克隆到的鸭Mel1c新基因,我们对该序列进行特征分析,并对其功能进行预测,为Mel 1c基因的功能研究打下基础。[方法]从脑组织中提取总RNA,利用RT-PCR方法扩增Mel 1c基因cDNA序列,将其克隆到pMD18-T载体上,测序后利用多种软件进行序列分析。[结果]成功的克隆了鸭Mel 1c基因部分序列,序列长为850bp,其编码283个氨基酸;鸭Mel 1c部分序列与已报道动物的Mel 1c同源性在74%-94%之间;氨基酸序列的同源性在61.8%-98.2%;该部分基因编码的蛋白质可能为-N端在胞内的六次跨膜蛋白,该蛋白还含有信号肽,为分泌蛋白:同其他物种褪黑素受体一样,该蛋白也含有G蛋白偶联受体家簇1的结构域,位于1-244之间;并与Mel 1a相似,N端亦含有两个糖基化位点[结论]成功的克隆了鸭Mel 1c基因部分序列,其编码的蛋白可能为分泌蛋白和六次跨膜蛋白,并含有G蛋白偶联受体家簇1的结构域,该基因编码的蛋白质可能同其他褪黑素受体一样在许多方面具有重要的作用,因此该基因又进一步研究的价值。
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