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根际是一个独特的环境，是受植物根系和根系分泌物直接影响的薄层土壤，植物和土壤微生物在这里发生着广泛复杂的相互作用。根际包含着复杂的微生物类群，一克根际土壤含有106-1010个微生物。这个复杂的微生物群体对宿主植物的健康和生长发挥着重要的影响。根际是微生物定殖和发挥活性的重要区域， 根系与土壤微生物之间的互作是特异的并处于共进化的压力下。根际微生物可以协助宿主植物抑制土传病害，提高养分的有效性和吸收，以及通过提高宿主植物免疫力抵抗生物与非生物逆境，从而促进植物生长。反过来，植物为根际微生物提供根系分泌物作为生长基质与信号分子。从应用角度上，研究植物与微生物在根际的互作对开发生物肥料和生物农药具有重要意义。