病理学诊断是结核病确诊的重要手段，传统病理学诊断是通过大体和镜下观察病灶组织的病理形态学改变来获得诊断结果，具有针对性强、准确性高等优势。目前肺结核病的病原体检查主要依靠痰标本的细菌学检查，近年来穿刺技术获得了迅速发展，如CT引导下的经皮肺穿刺活检术、超声引导下的针吸活检术等具有微创、精准、便利、低风险等特点，为菌阴肺结核病和肺外器官结核病的病理学诊断提供了更多的组织标本。免疫组织化学法是病理学诊断中常用的检测手段之一，近年来，研究发现利用识别结核分枝杆菌特异抗原的抗体用于免疫组织化学检查，可以提高结核病病理学诊断敏感性。分子病理学检测新技术在结核病诊断中具有检测灵敏度高、快速鉴别诊断结核病与非结核分枝杆菌症、快速鉴定非结核分枝杆菌菌种、快速检测耐药基因突变情况等优点。