【摘 要】
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目的探讨我国主要流行的结核分枝杆菌谱系2 （Lineage2）和4 （Lineage4）群体遗传结构和分布特征,为结核病的预防控制提供科学依据。方法采用长序列多态性（Large sequence polymorphisms,LSP）和标准15位点分枝杆菌散在重复单位-数目可变串联重复序列（variable number tandem repeats,VNTR）技术对来自全国31省市抽样调查的392
【出 处】
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中国防痨协会第33届全国学术大会暨中国防痨科技奖颁奖大会论文汇编
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目的探讨我国主要流行的结核分枝杆菌谱系2 （Lineage2）和4 （Lineage4）群体遗传结构和分布特征,为结核病的预防控制提供科学依据。方法采用长序列多态性（Large sequence polymorphisms,LSP）和标准15位点分枝杆菌散在重复单位-数目可变串联重复序列（variable number tandem repeats,VNTR）技术对来自全国31省市抽样调查的3929株结核分枝杆菌进行谱系鉴定和基因分型;针对基因型位点进行等位基因多样性计算。基于上述菌株15-VNTR数据,采用贝叶斯聚类法进行群体遗传结构分析;构建邻接（Neighbor-Joining,NJ）树和最小生成树（Minimum Spanning Trees,MST）进行群体遗传分化分析。运用主成分分析（principal component analysis,PCA）验证;采用分子方差（analysis of molecular variance,AMOVA）分析成对群体间遗传分化,计算遗传分化系数FST,推断群体间基因流动。采用卡方检验分析地理相关性。结果共鉴定出2900株谱系2结核分枝杆菌,占比73.8%（2900/3929）。聚类分析结果显示Lineage2可分为4群（groupl-4）;Group2是最古老的,主要分布于西南地区和东北三省。Group1,3,4是较现代的,遗传距离近,主要分布于我国中东部地区。Lineage2的传播是以group2为传染源,从西南和东北地区向其他地区进行播散。主成分分析显示4种遗传群体可以被区分开。共鉴定出975株谱系4结核分枝杆菌,占比24.8%（975/3929）;聚类分析结果显示Lineage4可分为5群（groupl-5）,group1是最古老的,主要分布于西南地区,可能是specialist。Group2,3,4,5是较现代的,在全国范围内盛行,可能是generalist。在groupl中出现了多个低等位基因多样性的基因型位点;分子方差分析显示group1与其他4种群体的遗传分化显著（P<0.05）。卡方检验结果显示各群体与地理区域之间有关联性,差异有统计学意义(χ2=900.93,P<2.2e-16)。结论在我国,结核分枝杆菌谱系2可分为4群,传播是以西南地区和东北三省为传染源进行播散。中东部地区分布的群体较现代,遗传距离近。结核分枝杆菌谱系4可分为5群,其中group1呈现出明显的地理局限性,尤其是在西南地区,并且该群体与其他4群有着显著的遗传分化。充分了解我国流行的结核分枝杆菌谱遗传结构特征及系统地理分布将会在中国结核病预防和控制中发挥关键作用。
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