根据2009年中共中央国务院印发的《关于深化医药卫生体制改革的意见》(中发[2009]6号)等一系列国家医改文件要求,北京市于2017年4月8日零时起,在本市行政区域内政府、事业单位及国有企业举办的公立医疗机构、解放军、武警部队在京医疗机构、政府购买服务的社会办医疗机构、城乡基本医疗保险定点的社会办医疗机构,共计3600余家医疗机构参与此次医药分开综合改革.此次改革的主要内容为取消药品加成和挂号费、诊疗费,设立医事服务费;实施药品阳光采购,降低药品采购价格;规范基本医疗服务项目,实施有升有降的调整.所有涉及以上改革内容的医疗机构信息系统将按照改革启动时间前完成系统开发,并在统一时点完成系统切换.北京市卫生计生委信息中心在此次改革中负责协调和督导全市参与改革医疗机构的信息系统改造工作,在医疗机构与上级部门之间架起桥梁.本文从此次改革工作的背景,信息化支撑工作的特点和主要做法以及改革顺利完成后对此项工作的思考等方面进行阐述,目的是为了下一步更好的支撑北京市医改工作,并为兄弟省市和医疗机构的医改信息系统支撑工作提供借鉴.