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丝瓜中特异性分子标记较少,严重制约了丝瓜分子标记辅助育种的发展。本研究中通过对2 601条丝瓜EST序列进行分析,优化设计出195对EST-SSR标记,并在有棱丝瓜S304、普通丝瓜93075及其种间杂交F1代植株间进行验证,分析重复基元和重复次数对标记多态性的影响,为后续研究提供参考。