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缺氧胁迫对贝类免疫系统的影响深远，影响到贝类血细胞的所有免疫参数，并降低贝类的免疫监视作用;而且在很多参数方面与其他胁迫都具有相似性。实验表明，缺氧条件(尤其是在静水条件下)能够增加贝类机会致病菌的繁殖，进一步降低水体的氧气含量，例如厌氧的硫酸还原菌能够导致水域的酸性化以及硫化物的积累。有证据表明，添加氯霉素和青霉素能够延长缺氧条件下双壳贝类的存活时间，尤其是提前利用氯霉素处理和食用鸟蛤，能够将其存活时间延长近1倍，主要就是抑制了病原菌的繁殖。