亚东鲑基因组中Tc1-like转座子的克隆与序列分析

来源 :中国海洋湖沼学会、中国动物学会鱼类学分会2012年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anran520
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  根据Tc1-like转座子的末端重复序列保守区设计单引物,以亚东鲑基因组DNA为模板,通过PCR扩增、回收、克隆和测序,得到长度分别为1670bp和1473bp的片段,命名为Tbt1和Tbt2.亚东鲑Tbt1、Tbt2序列与已知Tcl-like转座子的核苷酸序列相似度分别为99%、80%,表明亚东鲑Tbt1,Tbt2均属Tc1-like转座子超家族成员.序列分析表明,亚东鲑Tbt1,Tbt2编码的转座酶序列多处突变为终止密码子,从而导致两者均不能表达完整的转座酶;经与具有自主转座活性的鲽PPTN所编码的氨基酸进行比对,发现亚东鲑Tbt1,Tbt2编码的氨基酸存在较大的差异,主要表现为缺失,进一步证明亚东鲑Tbt1,Tbt2转座子已在进化过程中失活,不具有自主转座活性。
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