北极海底沉积物中菌群组成分析

来源 :2006全国海洋生物技术与海洋药物学术会议暨全国第九届海洋药物学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hldxiesj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来,随着现代分子生物学技术在生物多样性研究中的应用,人们不断加深对极地海洋微生物多样性的认识.目前的研究表明,许多海洋细菌,包括蓝细菌,都归为真细菌,在极地海洋环境中占优势地位,具有很高的生物多样性,存在大量有别于温带、热带海洋细菌的新类群;更为原始的古细菌是存在于极端海洋环境中的重要栖息者.古细菌是近年来发现的最新进展之一,虽然目前在生命树上,该菌的分枝较小,但不能认为就是种类少.一方面,系统进化树的构建过程决定了依赖对具体属种描述记载,才能通过聚类方法展示在已有系统树中.事实上,目前关于古细菌具体属种的微生物学特征描述极少,因而当出现依据新序列数据分析而不能给出常规属种比对归宿时,很可能就是一个以往不清楚的古细菌.本文通过构建16S rRNA基因文库对北极海底沉积物中细菌、古菌多样性进行分析.将获得的16S rRNA基因序列用ClustalX软件进行聚类分析,从每个OTU中挑取部分序列与国际基因数据库GenBank进行相似性比较,用Mega软件构建进化树,结果发现沉积物中的细菌种类大部分序列与已知细菌类群的16SrDNA序列相似性较高,包括α-Proteobacteria、γ-Proteobacteria和CFB(cytophaga-flexibacter-bacteroides),其中γ-Proteobacteria为优势菌群,部分序列与已知细菌类群的16SrDNA序列同源性较低,可能代表新的分类单位,而古菌种类主要集中在未能培养的泉古菌(Crenarchaeote).研究结果表明,取样部位的海区内不仅含有丰富的微生物物种,并且存在尚未被认识的新物种.这些发现有助于我们增强对极地微生物的认识,并对将来的应用具有重要意义.
其他文献
本文对生物催化不对称还原反应合成手性化合物的平台技术及工业应用进行了探讨。文章围绕生物催化不对称还原反应合成手性化合物的重要性、生物催化不对称还原反应合成手性化
本文对啤酒专用偏酸性蛋白酶产生菌的筛选及酶应用特性进行了研究。文章围绕偏酸性蛋白酶产生菌的分离筛选、偏酸性蛋白酶粗酶酶学性质、偏酸性蛋白酶在啤酒澄清中的应用等进
本文对纺织、造纸用纤维素酶制剂进行了研究。文章利用定向进化、分子改造等现代分子生物学技术改造菌种,改变菌种的表达谱,构建适合于不同应用领域的工程菌株、优化发酵条件,改
本文对我国糖化酶的进展进行了论述。文章指出,我国糖化酶产品已成为酶制剂产品产量最大的品种,出口亦达到较大的数量,当前的问题是产品售价已降至接近制造成本,企业获利甚微
目的:对本实验室制备的一种小分子量新型海洋纤溶酶的抗凝血和溶栓作用进行初步评价,为进一步进行动物实验研究打下基础.方法:以pH7.4的生理盐水作阴性对照,以蚓激酶作阳性对
日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺分泌液(lamphredin)具有抗凝的功能.Lamphredin优先降解人纤维蛋白原的Aα链,其次以较慢的速度降解Bβ链,但是并不降解γ链.Lamphredin
目的:建立测定细薄星芒海绵Stelletta tenuis Lindgren总萜烯提取物中Stellettin B和D含量的方法. 方法:采用HPLC-DAD方法.色谱条件为YMC Pack-SIL分析柱(250mm×4.6mm,5μm)
粒细胞集落刺激因子(G-CSF)是一种由170多个氨基酸构成的多肽,由人和哺乳动物细胞产生.主要用于治疗肿瘤患者因放疗、化疗引起的中性粒细胞减少症.用大肠杆菌基因工程制备时
从海南文昌头苑、清澜港以及东寨港红树林,深圳福田和广东湛江红树林采集127土壤以及植物组织样品,对样品进行可培养微生物的分离与生物活性测定,其中获得放线菌611株.结果显
对一株具有抗肿瘤活性的深海来源地真菌的发酵产物进行研究,分离得到六个sorbicillin类化合物,运用现代波谱学方法确定了其结构.结果表明化合物1是一个具有新型结构的sorbici