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沙门氏菌是最常见的食源性致病菌之一，其中肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、乙型副伤寒沙门氏菌、丙型副伤寒沙门氏菌、都柏林沙门氏菌及海德尔堡沙门氏菌等是较常见的致病性血清型.本研究的目的 是针对食品中存在的以上血清型建立了不同的多重PCR检测体系.利用NCBI数据库、BLAST比对系统及PCR验证的方法，分别获得了以上血清型的特异性基因及引物，并结合属特异性基因invA的扩增引物建立了4个多重PCR检测体系.其特异性被66株肠道致病菌验证为100％，且灵敏度达到100CFU/ml.人工污染牛奶实验证明，当增菌10h污染量为100CFU/ml时，各个检测体系均能获得阳性结果.以上证明，比较基因组能有效的发掘病原菌的特异性检测靶点，并由此建立的多重PCR检测体系能快速、准确的检测出以上的血清型.