三角帆蚌Rab3 cDNA全长克隆及鉴定

来源 :2011年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:softguner
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  运用RACE技术获得三角帆蚌Rab3基因的全长cDNA序列(GenBank登录号为HQ190954),序列全长1 707bp,开放阅读框666bp,编码221个氨基酸,5端非编码区为158 bp,3端非编码区为883bp.软件推测其编码蛋白相对分子量为24.92KDa.NCBI Blastp进行氨基酸序列同源性分析表明,与居蟹皮海绵(Suberites domuncula)的Rab-31ike(SdRab3)氨基酸相似性最高,为64%,构建进化树的结论也是先与居蟹皮海绵的Rab3-1ike(SdRab3)聚为一支.原核表达结果表明,在30℃,5h,1mM IPTG条件下,Rab3蛋白得到高效表达,其表达量约占菌体总蛋白30%.Western-blot检测表明,在健康组和病变三角帆蚌肝脏中,Rab3蛋白与β-actin的表达量比值分别为0.438和0.580,Rab3基因在三角帆蚌经病原菌侵染后,表达量上调,初步推测三角帆蚌Rab3蛋白可能与三角帆蚌瘟病有关.
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