一株猪源Asia1型口蹄疫病毒的全基因组序列测定及比较分析

来源 :中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十三次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:whg_2001
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采用RT-PCR方法对猪源FMDV Asia1/WHN/CHA/06株进行全基因组分段克隆和序列测定。结果表明,该毒株基因组全长816lnt,5’非编码区为1078nt,编码区全长6990nt,共编码2329个氨基酸,3’编码区为93nt,其后的poly(A)结构至少含有66个A,全基因组序列提交至Genbank(注册号为:FJ906802)。利用DNAstai软件将该毒株与genbank中参考毒株进行序列比较分析,结果Asial/WHN/CHA/06株与Asial/JS/CHA/05株遗传关系最为密切,同源性高达98.5%,该毒株与江苏毒株同属一个分支。
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