鸭肝炎病毒A、H株的分离鉴定与全基因组序列分析

来源 :第二届全国禽病分子生物技术青年学者论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liaonianyou
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  为了给研究鸭肝炎病毒(DHV)分子水平的致病机理奠定基础,进一步丰富DHV的遗传变异和进化信息。采用RT-PCR方法分段克隆获得DHAV-1 A、H株的全基因组序列并进行序列分析。结果显示,647 nt(不含poly(A)尾),5′和3′非编码区长度分别为583 nt和314 nt,单一开放阅读框架(ORF,6759 nt),编码2253个氨基酸;H株的基因组全长为7648 nt(不含poly(A)尾),5’和3’非编码区长度分别为482 nt和314 nt,单一开放阅读框架(ORF,6852 nt),编码2284个氨基酸;A株与DHAV-1参考株比较,其核苷酸同源性为93.4%~97%;H株与DHAV-1参考株比较,其核苷酸同源性为92.7%~95.8%。遗传进化分析表明,DHAV-1型主要分为两大群,一个亚群以03D株为代表,一个亚群以5886株为代表。此次分离的毒株A处于5886群,毒株H处于03D群。
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