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蛋白酶是水解蛋白质肽链的一类酶的总称，在细胞代谢过程中扮演着重要作用.蛋白酶在自然界中的来源非常广泛，动物、植物、真菌、细菌、古细菌和病毒中均含有蛋白酶.基于其pH特性，蛋白酶分为酸性蛋白酶、碱性蛋白酶和中性蛋白酶三类.蛋白酶在日用化工、食品、医药等行业应用广泛.最新数据显示，至2015年世界工业用酶的销售总额达到37.4亿美元，其中40％来自蛋白酶.因此蛋白酶被认为是最重要的工业用酶之一.商品化的蛋白酶主要产自芽孢杆菌.迄今为止，许多来自细菌的蛋白酶已经被成功鉴定了，可是仅有几个具有工业应用前景，而且来自宏基因组的蛋白酶仍然很少被报道.因此，利用宏基因组技术从未培养微生物中发现新的蛋白酶依然很有必要.