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2013年3月到7月在我国采集和收集了635份小麦叶锈菌标样,获得345个单孢子堆菌株,划分为86个生理小种,其中优势生理小种为THTT、THTS、PHTT、THSS、PHTS、THKT,出现的频率分别为24.6%、14.5%、7.5%、5.2%、2.9%、2.9%。以麦区为单位,分析生理小种的组成和分布。研究发现,新疆冬春麦区的92个菌株划分为21个生理小种,优势生理小种为THTT(50.0%)、THTS(15.2%);北部春麦区的7个菌株,划分为7个生理小种;北部冬麦区32个菌株,划分为16个生理小种,优势生理小种为THTS(15.6%)、PHTT(15.6%)、THTT(12.5%);黄淮冬麦区145个菌株,划分为54个生理小种,优势生理小种为THTS(13.8%)、THTT(11.0%)、THSS(10.3%)、PHTT(9.7%);长江中下游冬麦区的25个菌株被划分为15个生理小种,优势生理小种为THTT(32.0%)、THTS(12.0%);西南冬麦区的44个菌株划分为20个生理小种,优势生理小种为THTT(25.0%)、THTS(18.2%)、PHTS(11.4%)。除北部春麦区外,THTT、THTS为各麦区的优势生理小种;PHTT在各麦区都有出现,并为北部冬麦区和黄淮冬麦区的优势小种;THSS和PHTS除新疆冬春麦区和北部春麦区外,在其它麦区均有分布,并分别为黄淮冬麦区和西南冬麦区的优势小种。各麦区都有独特的生理小种类型存在。以省份为单位,分析各省生理小种的组成特点。各省小麦叶锈菌群体的生理小种组成复杂,有多个生理小种组成,不同群体的组成不同。除四川、贵州和安徽外,其它各省都有独特的生理小种类型存在。除内蒙古和浙江外,其它各省均有优势小种存在,不同省份的优势小种类型和比例有所不同。根据对各麦区及省份的小麦叶锈菌毒性频率的分析可知:我国目前有效的抗叶锈基因有Lr9、Lr19、Lr24、Lr38、Lr39、Lr42、Lr47;丧失抗性的抗病基因有Lr1、Lr2a、Lr2c、Lr3、Lr16、Lr26、Lr3ka、Lr11、Lr17、Lr21、Lr B、Lr10、Lr14a、Lr2b、Lr3bg、Lr14b、Lr29、Lr32、Lr33、Lr33+34、Lr25、Lr37、Lr50。利用POPGENE32软件计算群体间的遗传距离和遗传相似系数,发现各群体间的毒性相似性较高,亲缘关系较近。利用MEGA6软件对2013年我国小麦叶锈菌群体进行了基于毒性特征的聚类分析。研究发现,地理位置相邻的小麦叶锈菌群体可聚在同一类群,也有可能聚在不同类群;地理位置上不相邻的群体有可能聚在一起;说明小麦叶锈菌的毒性与地理来源有一定的相关性,但并不完全相关。这可能是小麦叶锈菌群体在当地发生遗传变异,也通过气流进行远距离扩散。