我国矿产资源的有偿使用起步较晚,至今尚未形成一种完善有效的制度。资源浪费与环境破坏是矿产资源有偿使用中比较突出的问题,极大的影响了经济与社会的可持续发展。在分析中,论文首先区别了两类问题——制度本身存在的问题与制度不完善所引发的问题,并就这两类问题进行了分析。有偿使用制度中的税费关系不清与税费设置的不合理给予矿山企业以沉重的负担,不利于企业对资源的节约和对环境的保护,而矿业权流转不顺畅显然也阻碍了矿产资源的充分利用与优化配置。有偿使用制度不完善所引发的问题以“四矿”问题为代表,基本涵盖了矿业经济发展中的主要矛盾。由此,文章结合现实中比较突出的“四矿”问题对矿产资源的有偿使用制度作出了进一步的分析,并说明了有偿使用制度完善的重要意义。之后,文章从新制度经济学的视角出发,将产权理论、交易费用理论、外部性理论、公共领域理论及委托—代理理论运用到对矿产资源有偿使用制度的分析中,从分析矿产资源的产权属性入手,分析了交易费用在矿产资源有偿使用中的重要意义,并研究了环境的负外部性内部化问题及政府与矿山企业之间的委托—代理关系问题。分析认为对环境权利进行共有产权的界定能比较好的解决资源开发造成的负外部性问题,而过于繁复的税费侵占了企业的剩余索取权,不利于企业对矿产资源的有序开发,同时也挤占了矿产资源补偿费的份额,不利于资源所有者权益的实现。最后,文章分别从明晰矿产资源产权、合理界定环境权利、建立资源耗竭补偿机制、完善资源价格形成机制等方面给出了促进我国矿业经济可持续发展的几点政策建议。