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农民专业合作社(简称“合作社”)是新时期随着农业集约化生产和发展方式转变进程中衍生的新型组织形式,随着市场经济地持续快速发展,其在解决“三农”发展中出现的难点、痛点中起到的作用日益凸显,其可以解决农户分散小生产与大市场的对接问题,可以服务带动传统农民进行规模化生产,日益成为提升农民组织凝聚力、农村稳定性、农民收入水平和农业发展持续力的重要抓手。对推进新农村建设、农民发展现代农业、提升幸福感具有积极重大作用。最近几年,各级地方政府大力宣传引导农民专业合作社发展,出台了各类促进合作社发展壮大的扶持政策,鼓励和建立了一大批成功的合作社,并不断加大鼓励扶持的力度,加之我省当前正在大力发展高原特色农业。在这样的背景下,剑川县农民专业合作社呈现出突飞猛进的增长,2010年时注册登记的只有9户,到了2016年已迅速扩大到233户,日渐成为了一种规模化、集约化和专业化的新型经济组织形式,也成为税收部门开展税源管理和组织税收收入的新成员和新对象。就税收管理角度来说,随着农民专业合作社的迅猛发展,它们给税务机关的征收管理带来了新的挑战和新的问题。当前,大多农民专业合作社从业人员普遍存在文化水平较低、财务管理水平落后、所在生产经营场所地处偏远、纳税遵从度低等原因制约了税务机关对于农村专业合作的正常管理,且由于农民专业合作社的生产经营涉及增值税的减免、企业所得税优惠、增值税抵扣等税收征收管理敏感领域,存在很多潜在的且不容忽视的税收管理漏洞和执法风险,因此,如何加强对该行业的税收管理及纳税服务,探寻规范化、科学化、长效化管理方式,提升纳税服务水平,显得非常迫切。本文采用文献资料、调研访谈法、个案研究法,笔者开篇通过介绍合作社及税收征收的一些核心理念,以期厘清一些基础理论,并从剑川县农民专业合作社税收管理概况着眼,就目前该类特殊组织的税收管理问题进行探讨,指出剑川县农民专业合作社税收管理存在的问题,并提出解决问题的路径、方法,探索如何全面、准确、到位运用税收管理支持、扶持剑川县合作社农业提质增效,从而找到解决途径,促进其健康发展,打赢扶贫攻坚战,实现农民增收、农业增效、农村发展,为税务部门做好合作社的税收管理工作都具有很大的意义。笔者通过对以上问题的研究分析,期望自己的浅陋见解对加强辖区此类纳税人管理有所帮助。