近年来,全球经济复苏缓慢,国内形势复杂严峻,商业银行经营管理面临困难。内部审计作为公司治理的重要组成部分,凭借其在防范风险、完善治理等方面的积极作用,获得了银行业前所未有的重视,内部审计机构能否有效履行职责对于商业银行的经营发展至关重要。国内外关于内部审计的研究侧重于准则和概念理论方面,针对商业银行内部审计的系统性研究相对较少,本文在梳理归纳相关文献结论的基础上,认为委托-代理理论是内部审计的逻辑起点和理论基础,据此去研究和解决JS银行派出内部审计机构履职失效的问题。通过研究,本文指出JS银行派出内部审计机构履职失效的问题主要表现为:审计发现不了问题、审计发现了问题却瞒而不报、审计发现的只是表象或过时的问题、审计发现问题没有得到及时解决、审计发现问题屡查屡犯等,最终都会导致风险暴露和损失形成。特别是与同业相比,JS银行内部审计的投入产出效率偏低,大量的资源投入并没有体现出超出同业的效果。这些问题与JS银行特殊的内部审计机构设置管理模式有关,根本原因在于内部审计的独立性受到了损害,多层分支机构管理模.式下的代理人问题并没有得到有效解决等,同时派出内部审计机构的自身管理问题也是影响其职责发挥的制约因素。为有效解决上述问题,本文针对JS银行总行层面提出内部审计应由审计委员会领导并设立首席审计官、内部审计应严格定位于第三道防线等建议,针对派出机构层面提出内部审计机构应按区域集中设置、人财物管理应完全垂直独立以及任务安排、质量控制、队伍建设和激励约束等方面的具体对策。