拟南芥AT2G17350基因功能的初步研究

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拟南芥是十字花科拟南芥属的一种草本植物,它广泛分布于世界各地。作为模式植物其基因组测序早已公布,但仍有大量的基因功能未知。本研究主要从反向遗传学角度对未知基因AT2G1 7350的功能进行初步的探讨。分析该基因在不同条件下转录水平和蛋白水平的表达情况,以推测该基因可能具有的生物学功能,为进一步的实验研究奠定基础。本研究的主要内容和结果如下:1.采用实时荧光定量qRT-PCR方法对AT2G17350进行基因表达分析:检测AT2G17350基因分别在低温、高温、短时间脱水和外源激素ABA.GA3.MeJA处理条件下的表达情况。结果显示AT2G17350基因对低温、高温、短时间脱水处理都表现出应激反应;在外源激素的诱导下,该基因表达量显著上调。初步推测AT2G17350基因响应植物的胁迫诱导,可能在植物的生长发育过程中起着关键的作用。2.对AT2G17350基因进行生物信息学分析,预测得到四个可能与其互作的蛋白,它们分别为AT3G25980 (MAD2,有丝分裂纺锤体检验点蛋白)、AT5G65940(CHY,一种具有水解酶活性的过氧化物酶蛋白,对脂肪酸的新陈代谢起着重要的作用)、AT4G16143 (IMPA-2,一种胞内转运蛋白)、AT4G02150 (IMPA-3,一种参与蛋白转运和绑定的蛋白,并响应胁迫)。这四种蛋白在生物过程中都发挥着重要的作用,并且它们之间不存在共表达的关系。克隆发现CHY、IMPA-2和IMPA-3这三条基因除了Tair网站公布的已有剪切方式外,均还存在更多的剪切方式。其中CHY和IMPA-2还存在5种剪切形式,IMPA-3也还存在另一种剪切方式。3.利用酵母双杂交方法研究蛋白的相互作用,结果表明AT2G17350蛋白与MD2、IMPA-2、IMPA-3蛋白具有相互作用。同时构建了原核表达载体,采用GST-Pull down的方法对酵母双杂交结果进行体外验证。进一步证明了AT2G17350与MAD2具有相互作用,推测AT2G17350可能参与细胞有丝分裂过程。4.结合AT2G17350干涉、过表达植株和MAD2、CHY、IMPA-2、IMPA-3的突变体植株,运用qRT-PCR对这五条基因的相互关系进一步研究。结果表明:①五条基因在花、果荚、枝叶和莲座叶中均有表达,其中在花和果荚中表达量都显著上调,表达模式基本一致。②AT2G17350在其它四条基因的突变体中表达量都显著上调,表明当其他基因缺失时,AT2G17350可能发挥着一种补偿作用。③MAD2在AT2G17350干涉植株的果荚和AT2G17350突变纯合体(HM)中表达量上调,过表达植株的果荚中下调,说明AT2G17350和MAD2可能存在一种拮抗关系。④从IMPA-2和IMPA-3在AT2G17350的干涉、过表达和HM植株中表达情况来看,AT2G17350与IMPA-2和IMPA-2相关性不大,具体的关系还需进一步研究。5.从文献中筛选得到7条有丝分裂相关基因,分别为MAD1、ATM、BRCA1、 Bub3、cdc20、CDK和Mpsl(均为有丝分裂检验点的关键蛋白,参与DNA的损伤应答)。在已有的植株中分析它们的表达量,结果表明这些基因在AT2G17350的干涉和突变纯合体HM植株中表达量都显著上升。说明AT2G17350表达的变化影响了这些基因的表达量,进一步推测AT2G17350基因在有丝分裂过程中起着一定的作用,可能参与了DNA损伤和修复过程。本研究在不同处理和诱导情况下检测得到AT2G17350响应胁迫诱导,参与植物的生长发育过程。通过酵母双杂交和GST-Pull down实验得到AT2G17350和MAD2具有相互作用,推测其可能在细胞有丝分裂过程中起重要作用。分析上述四条基因和部分有丝分裂基因在AT2G17350干涉、过表达植株和MAD2、CHY、 IMPA-2、IMPA-3突变体植株中的表达模式,结果表明AT2G17350和MAD2在基因表达水平上可能存在一种拮抗关系。而有丝分裂相关基因的表达进一步指出AT2G17350可能参与了有丝分裂过程中DNA损伤和修复。该结果为后期研究未知基因AT2GI7350的功能提供了参考方向和依据。
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