1992年，联合国环境与发展大会在巴西里约热内卢召开，大会通过了《生物多样性公约》，标志着世界范围内的自然环境保护工作进入了一个崭新的阶段，即从以往对珍稀濒危物种的保护转入到对生物多样性的保护。生物多样性公约有三个主要目标：保护生物多样性；生物多样性的可持续利用：以公平合理的方式共享遗传资源的商业利益和其它形式的利用。 生物多样性的经济学分析，着眼于利用环境经济学的理论和方法，设计以市场为基础的各种经济手段，使经济的外部性内在化，通过有效的激励机制，来实现保护和可持续利用生物多样性的目标，进而实现人类福利的最大化。 激励机制是生物多样性公约的重要议题之一，其制定和实施是为了影响政府机构、企业、非政府组织或当地人民保护生物多样性或可持续地利用。激励机制通常都以新政策、法律或经济或社会方案的形式出现。而经济手段是常用的最有效的激励机制。经济手段是能经济机构开发的替代行为的成本与效益的工具。与直接的行政手段相比，经济手段更能反映经济机构对各种激励机制选择的自由。本文就是以生物多样性公约为中心，阐述经济手段在生物多样性保护中的运用。 经济手段包括财产权、建立市场、收费、财政工具、环境基金等多种方式，各种手段在不同的环境保护领域都有各自不同的功用。同时实施经济手段还需要一些条件因素，如生态系统服务的价值评估、利益相关方的参与、能力建设等，做好这方面工作，有利于经济手段的可持续有效运用。 目前，我国正在讨论和制定生态补偿机制。很多学者根据我国实际，提出了生态补偿机制中经济手段的运用方案。本文对我国生态补偿制度的现状做出分析，提出问题，建议通过建立自然资源产权制度、资源价格制度、排污费制度、环境税制度和环境基金制度等制度，完善我国的生态补偿制度。