流动剪切和力学牵拉作用下P-选择素/PSGL-1解离的分子动力学模拟

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shijunjie88
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白细胞在炎症组织处血管内皮表面的捕获和滚动由表达在炎症组织处血管内皮表面的P-选择素与表达在白细胞表面的PSGL-1之间的特异性相互作用所介导。在此过程中,P-选择素/PSGL-1复合物受到两种外力的作用,即白细胞滚动时的牵拉作用和近血管内皮表面的流场剪切作用。为了模拟接近生理的力学作用下此受体/配体复合物的解离过程与结构改变,本文采用分子动力学模拟方法,构建了可控制速度梯度的剪切流场以及可准确控制分子一端运动轨迹的轨迹牵拉法,评估了不同流场模型参数对流场形成的影响。针对P-选择素/PSGL-1的最小功能单位P-LE/SGP-3分子系统,施加剪切流场、轨迹牵拉或二者耦合作用,考察剪切流场和细胞牵拉力在复合物解离过程中的作用。模拟结果表明,P-LE/SGP-3的解离伴随着分子复合物内部构象的破坏,主要源于EGF功能区中两个反平行β折叠片的破坏,以及Lec-EGF两功能区之间氢键的断裂,P-LE/SGP-3结合面的解离源于钙离子Ca2+与岩澡糖FUC623质量中心间距离的增加。三种力学条件作用下,P-LE/SGP-3复合物的解离表现出相同的时序关系,但P-LE/SGP-3复合物解离速度及解离时分子内部破坏程度不同,剪切流场和轨迹牵拉耦合作用及剪切流场单独作用时的影响大于轨迹牵拉法。因此,与牵拉作用相比,剪切流场在P-LE/SGP-3的解离过程中同样起着重要作用。研究结果可为在更加接近生理的力学条件下模拟P-选择素及其的结构基础提供新的认识。  
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