人参(Panax ginseng)和西洋参(Panax quinquefolius)Ty1/copia-like反转录转座子反转座酶序列的克隆和分析

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利用 Ty1/copia-like 类反转座子反转座酶的保守位点设计引物,从人参和西洋参基因组中扩增得到长度为 240bp 左右的 PCR 产物。对扩增产物进行分离和克隆,并随机挑选了 80 多个克隆进行测序,结果得到了 60 个不同的序列。Blast X 分析表明,这些克隆均为真实的反转录酶序列。根据序列比对,这些序列可分为 7 组以及单个的 3 组。这些核苷酸序列组内和组间均具有较大的差异,说明其核酸序列的高度异质性。这些序列中有 47 个是完整的,其余的有移码突变、终止子或二者兼有。South
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