邻苯二甲酸二丁酯(DBP)水解酶基因的克隆与功能分析

来源 :暨南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woshilidefu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
随着全球工业化进程的不断向前推进,塑料制品产量居高不下。邻苯二甲酸酯(Phthalic acid esters,PAEs)作为塑料制品中重要的添加剂,随着塑料制品的大量使用而残留于环境中并引发环境污染。而且,PAEs是一类典型的内分泌干扰物,部分具有致癌、致畸、致突变效应,可通过食物链传递进入人体,危害人体健康。邻苯二甲酸二丁酯(DBP)是一种常见的PAEs化合物,因其在环境介质中普遍检出,毒性危害严重,被多个国家或组织列为优先控制污染物。因此,如何有效控制和消除环境中的PAEs污染已成为当务之急。目前,微生物降解因成本低廉、有效、无二次污染等特点,已成为PAEs污染修复的重要手段之一。但关于PAEs微生物降解分子机理方面的研究还很薄弱,这在很大程度上影响了降解菌对环境污染修复功能的应用。本文以DBP为目标污染物,选取课题组前期筛选得到的PAEs降解菌Rhodococcus sp.2G为研究对象,通过构建基因组文库筛选克隆获得了DBP水解酶基因,经外源蛋白表达与纯化,研究了DBP水解酶的酶学性质;采用光谱学手段结合分子模拟对接技术,研究DBP与水解酶的结合特性以及水解酶构象的变化,揭示了DBP与水解酶的结合机理。本研究不仅为完整阐述PAEs微生物降解分子机理提供理论基础,还为高效降解工程菌的构建与应用提供基因资源。主要研究结果如下:(1)基因组文库的构建:为获取DBP水解酶基因,构建了降解菌Rhodococcus sp.2G的基因组文库。在所构建的基因组文库中大约产生了18000个转化子,通过三步筛选法获得一个具有DBP降解活性的阳性转化子,将其命名为2G-I。对其重组质粒中插入的基因片段测序与分析得出,该基因片段大小为795 bp,且具有一个ORF,与Rhodococcus sp.2G全基因组测序结果中的α/β-水解酶基因中的ORF相似度高达100%,将其命名为Hyd基因。(2)Hyd基因生物信息学分析:运用生物信息学软件,由Hyd基因推断出Hyd蛋白氨基酸序列,经过蛋白家族和保守结构域查询表明,Hyd蛋白属于α/β-水解酶家族,是α/β-水解酶(CL0028)中的PF00561成员,具有典型的α/β-水解酶超家族结构。此外Hyd蛋白的一级、二级结构预测表明Hyd蛋白是由264个氨基酸组成,分子式为C1289H2015N367O372S6;分子量(M)为28.79 kDa,等电点(pI)5.27;且蛋白二级结构中α-螺旋、β-折叠以及无规则卷曲的含量分别为42.5%,16.67%和41.29%。(3)Hyd基因原核表达与纯化以及酶学性质研究:重组Hyd蛋白在温度为20℃条件下,经0.5 mmol/L IPTG过夜诱导实现了高水平表达,SDS-PAGE分析显示在35 kDa处出现了特异表达的蛋白条带,表达蛋白经纯化和Western Blot验证为诱导表达的特异蛋白。当DBP浓度为27.83 mg/L,0.1 mg Hyd蛋白在5min内对DBP的降解率可达65%;Hyd蛋白最适反应温度为37℃,在20-50℃的温度范围内可有效降解DBP;最适反应pH为7.5,在pH=6.0-8.0内均可有效降解DBP。(4)DBP与Hyd蛋白的作用机制:采用荧光光谱法和分子模拟对接技术测定了DBP与Hyd蛋白的相互作用模式,结果表明:DBP分子嵌插入由Leu29、Ser93、Phe94、Ala97、Pro118、Ile120、Pro123、Ile130、Thr190、Ser191、Trp192等氨基酸残基构成的疏水性空腔之中,通过与Hyd蛋白结合结合形成基态复合物而猝灭Hyd蛋白的内源荧光;DBP不仅与疏水性氨基酸Leu29、Ala97、Ile120、Ile130、Trp192等发生疏水性作用。同时,DBP分子还与Thr190、Ser191形成两个氢键,键长分别为2.0?和2.1?。此外,紫外-可见吸收光谱、同步荧光光谱、圆二色谱分析表明,DBP在与Hyd蛋白结合的过程中,DBP对Hyd蛋白的构象造成影响,导致Hyd蛋白二级结构中的α-螺旋含量降低,表明DBP与Hyd蛋白多肽主链的氨基酸发生结合,引起多肽链的重排和结构变化,多肽链部分伸展导致某些疏水区域被暴露,进而为DBP与Hyd蛋白结合提供反应空间。
其他文献
研究了石粉细度与含量对水泥砂浆力学性能与含气量的影响,结果表明,掺入一定量的石粉能够改善水泥砂浆的工作性能,但>15%后,其强度开始下降;而在石粉含量相同时,掺入粒径<0.0
针对银行等高安全性要求场所使用的防尾随联动安全门可能存在误锁、误开、不能及时关闭,需要集中实时监控的情况和需求,设计了一种防尾随联动安全门状态监测控制系统。该系统
结合某工程提出了一种新型构件--空间桁架梁,通过多个算例分析比较,表明空间桁架梁具有很好的整体稳定性能,适用于大跨屋盖结构,在进行强度、挠度分析时可以按平面桁架计算.
【目的】综合评价水环境质量,全面把握水环境污染特征是水环境治理中的重要基础性工作。【方法】采用综合水质标识指数评价法对2016年九洲江水质进行评价。【结果】九洲江9个
目前消费者对小家电的需求不只停留在功能层面,更有对视觉化的追求和情感的需求,因此探究小家电产品中情感化的融入就显得至关重要。在极简主义思想的指导下,通过情感化设计
针对非平稳信号的去噪问题,提出一种基于聚合经验模态分解(EEMD)的改进小波阈值函数去噪方法。首先应用EEMD对信号进行分解,然后通过方差贡献率法去除分解过程中出现的伪特征
本研究观察了慢性束缚致疲劳动物模型海马组织氨基酸水平的变化及中药的调节作用。结果显示:①模型组动物的多数氨基酸有水平有上调趋势,其中苏氨酸、缬氨酸、牛磺酸及总氨基酸
近年来,随着计算机技术与通信技术的快速发展,其在航运业的应用也越来越广泛。船舶往往在一定航区一定航线内运营工作,所以可通过收集船舶运行时的各种参数,如主辅机燃油消耗
<正> 抗衰老是本世纪末及21世纪的研究重点,中医药有关抗衰老方药的研究文献十分丰富,研究所涉及的方药很多,按其功效主要为补肾、健脾、活血祛瘀三大类。有单味药上百种,复
介绍光固化成型技术的基本原理和研究现状,分析我国无人机植保喷头的研发特点。利用光固化成型技术制备无人机植保常用的扇形喷头,并搭建基于激光粒度分析仪的喷雾性能检测试