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马绒毛膜促性腺激素（equine Chorionic Gonadotropin,e CG）,是妊娠期32-150 d母马胎儿绒毛膜环带和子宫内膜杯滋养层双核细胞分泌的一种生殖激素,能够促进动物发情、排卵、诱发双胎、提高公畜精液品质。我国拥有丰富的马匹资源,但却对e CG的研究尚浅,e CG结构及如何行使功能目前还不明确。至今全世界e CG的规模化生产仍然单纯利用采集妊娠母马血液后提纯的方式,但相关方法还停滞在数十年前,亟待提高和创新。本研究通过生物信息学预测分析e CG的结构等分子特征,并根据e CG特殊生物学功能,预测出决定e CG发挥生物学功能的结构区域;开发一种新的蛋白质纯化技术从孕马血清中分离纯化出纯度较高且比活达到国家规定兽用标准的e CG,为研究e CG如何行使生物学功能奠定基础。使用生物信息学软件分析e CG的分子特征发现,e CGα和e CGβ的酸性氨基酸残基总数（Asp+Glu）相同,但e CGα碱性氨基酸残基总数（Arg+Lys）多于e CGβ,两个亚基均呈碱性且不稳定。e CGα呈亲水性,而e CGβ呈疏水性;e CGα和e CGβ均具有3个较强的疏水性区域和2个较强的亲水性区域;与e CGβ对比,d CGβ和z CGβ仅有12和9个氨基酸残基存在差异;马属动物CGβ的N-糖基化位点相似,但可能发生O-糖基化的位点及其发生的可能性均有差异;二级结构预测发现e CGα氨基起始端以α螺旋为主,伸展链、β转角、无规则卷曲交替排列;e CGβ无规则卷曲为整个序列的主体结构元件;成功对接得到e CG的三维结构,得到的复合体N端并未结合紧密,而C端向蛋白内核折叠,整个蛋白的中部呈现出亲水性表面包裹疏水性内核的特征。经过偏磷酸沉淀、阴离子交换层析、琼葡糖凝胶层析和阳离子交换层析等纯化步骤,并测定BCA总蛋白浓度、ELISA活性和SDS-PAGE纯度鉴定以及使用大鼠卵巢增重法测定活性,开发一种实验室用纯化e CG方法,最优纯化条件为加入0.5mol/L偏磷酸至p H3.5,0.1mol/L Na OH调HPO3上清液至p H 5.0;DEAE-FF层析中使用p H5.0 0.10mol/L Na Cl 0.01mol/L乙酸-乙酸钠缓冲液洗脱;琼葡糖凝胶层析中使用0.01mol/L乙酸-乙酸钠缓冲液洗脱,收集在90-150min洗脱液;SP-FF层析中,使用p H8.5 0.2mol/乙酸-乙酸铵缓冲液洗脱。最终纯化得到e CG比活为1490.33IU/mg,大鼠卵巢增重法测得e CG比活为1427.00±105.07 IU/mg,活性回收率为52.14%。综上,提出了e CG发挥生物学功能的预测结构区域,开发了一种实验室用低蛋白浓度高比活的e CG纯化方法。这对e CG结构与功能以及完善我国e CG纯化体系具有一定的指导意义。