Bacillus Cereus B-02拮抗作用相关基因的克隆及其表达

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蜡样芽孢杆菌B-02(Bacillus cereus B-02)分离自淄博市郊区感染灰霉病的大棚蔬菜土壤,是一株具有很强的抗番茄灰霉病菌(Botrytis cinerea)活性的拮抗细菌。为探讨该菌株对Botrytis cinerea的防病机理,本研究根据从Bacillus cereus B-02突变体基因组DNA扩增到的DJ-T02基因片段(573 bp),设计3条嵌套的特异性引物,与5条短的随机简并引物组成的引物库,分别用热不对称交错PCR法从Bacillus cereusB-02基因组DNA扩增该片段的5′和3′旁侧序列,经产物回收、测序、剪切拼接后,得到一段长2344 bp的MZ-BcP序列。结合生物信息学及相关分析软件,对MZ-BcP序列进行分析,将该序列在Genebank中进行blastn同源性比对,发现该序列与芽孢杆菌(如Bacillus thuringiensis,Bacillus cereus)质粒的部分序列同源性较高,同源区序列编码蛋白为假定蛋白,具体功能目前尚未有研究。为了进一步研究位于Tn917插入位点处的基因与Bacilluscereus B-02具有强拮抗性之间的分子调控机制,本研究通过DNAStar等生物信息学软件对MZ-BcP序列进行开放阅读框(ORF)的查找,得到5个均包括Tn917插入位点的ORFs,分别为585 bp、498 bp、453 bp、321 bp、99 bp。根据功能ORFs注释原则:对于有重叠的ORF,选取与已知基因或蛋白质motif/domain有相似性的或选取较长的ORF,短于150 bp的ORFs,若没有与已知的蛋白motif/domain具有相似性,则被除去。本研究选用较大的ORF(585 bp)进行实验验证,并经DNAStar翻译后在NCBI中进行blastp比对,得知该翻译片段与Bacillus thuringiensis质粒上的一段复制蛋白同源性最高,分子量为22.3 kD,推测其可能为与抑菌活性相关的新基因或调控因子。为了进一步验证该片段与Bacillus cereus B-02拮抗性的关系,即该ORF能否成功表达,用585 bp ORF作为目标基因片段进行克隆扩增,构建原核重组表达载体pET-32a(+)-MZF585并转化E.coli BL21(DE3)感受态菌株进行诱导表达,得到相对分子量约为42.3 kD的融合表达蛋白,理论推测值与实际表达值相符合。
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