近年来，海关总署党组从海关改革发展全局和自身工作实际出发，多次强调要进一步加强自身建设、加大内部控制力度，有效防控执法风险、管理风险和廉政风险。为适应新形势下有效防范“三大风险”的客观需要，2010年，海关总署制定并印发了《海关总署党组关于进一步加强和完善海关内控机制的意见》，以前所未有的战略高度做出这一重大决策部署，使海关内部控制建设迈入新的发展阶段。经过6年的发展，海关内部控制工作取得了显著成效，对海关管理水平的提高起到了重要作用。但是，近年来海关系统发生的违法违纪案件也时刻提醒我们，海关外部执法环境还十分复杂，内部廉政隐患依然存在，基础工作还存在薄弱环节，系统性区域性风险不容忽视。为进一步完善海关内部控制工作，亟需对海关开展内部控制过程中遇到的问题和薄弱环节进行梳理研究，提出对策建议，促进海关内部控制的有效开展。本文借鉴COSO内部控制-整体框架理论，提出了海关内部控制的定义、目标、原则和要素，完善了海关内部控制的理论基础，并以黄埔海关为例，对其内部控制现状及成效进行总结，指出当前直属海关内部控制工作存在的设计弊端和运行缺陷，提出优化和完善直属海关内部控制的对策建议。