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食管癌的死亡率在我国恶性肿瘤中居第四位,鳞状细胞癌是我国食管癌的主要病理类型,总体五年生存率仅约10%。为鉴定与食管癌关系密切的基因,本研究从染色体畸变的角度出发,在实验室前期工作及相关文献的基础上,统计分析食管癌染色体畸变谱,发现3、5、8号染色体重排及着丝粒断裂再重组可能是最常见的结构改变,3q、8q增益是最常见的数目异常。本研究首先选择食管癌中结构改变较多、扩增频率最高的染色体区段3q进行分析。依据本课题组前期对27例标本3q24-q29(跨越75Mb)的28个位点的扩增频率分析,我们绘制了3q26-q27区段23个位点扩增频率改变的趋势图。鉴定了3q26.2、3q26.31及3q26.33三个扩增子,在扩增子内挑选了MDS1,PRKCI,ECT2和PIK3CA四个候选基因进一步分析。双色荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测108例食管鳞癌发现MDS1,PRKCI,ECT2和PIK3CA的扩增率分别是53.5%、53.4%、40.0%和32.3%,MDS1和PRKCI在食管癌组织及细胞系中均存在共扩增的现象,但只有PRKCI基因的扩增与浸润深度(P=0.043)、淋巴结转移(P=0.015)及病理分期(P=0.002)相关。定位于3q26.2上的PRKCI(也称为PKCι)基因编码的蛋白是一种不典型的丝氨酸/苏氨酸激酶,目前对其在具体肿瘤中作用的研究还相对较少,为此我们对该基因在食管癌中的作用进行了深入的研究。对31例食管癌标本同时进行了FISH检测和免疫组织化学分析,结果显示PRKCI扩增与过表达存在相关性(P=0.009),食管鳞癌中PRKCI拷贝数增加是PRKCI蛋白表达上调的重要机制。食管癌组织微阵列的免疫组化分析发现PRKCI基因过表达与淋巴结转移(P=0.002)和肿瘤分期(P=0.004)相关。多变量统计分析进一步说明PRKCI基因是3q26上与食管癌淋巴结转移相关的独立因素。以上结果提示,染色体3q26上的PRKCI基因,通过扩增导致的PRKCI失调可能在食管癌演进中发挥重要作用,PRKCI可能成为判断转移及肿瘤分期的候选分子指标。