抗生素和抗生素抗性基因(ARGs)作为新型污染物,在水产养殖环境中分布广泛。为了研究江苏甲壳类动物水产养殖环境中抗生素和抗性基因的污染特征,本文选取中华绒螯蟹、克氏原螯虾和罗氏沼虾典型水产养殖环境作为研究对象,通过超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)研究了水样和沉积物中5类(大环内酯类、四环素类、β-内酰胺类、喹诺酮类和磺胺类)40种抗生素的浓度水平,并利用风险商值法评估其生态风险;利用16S r RNA扩增子测序分析了养殖环境中细菌的多样性和群落结构;利用宏基因组测序揭示了抗生素抗性基因(ARGs)的丰度和多样性、可移动遗传元件(MGEs)的分布特征,以及它们之间的相关性。结果表明:每个采样点都存在一定的抗生素污染和生态风险,其中XY1和XY2(盱眙两个克氏原螯虾养殖塘)抗生素污染水平和生态风险最低,GC2(高淳中华绒螯蟹养殖塘2)和GY3(高邮罗氏沼虾养殖塘3)最高。细菌的丰富度和多样性在克氏原螯虾、罗氏沼虾和中华绒螯蟹养殖环境中依次降低。Proteobacteria(变形菌门)是所有沉积物和中华绒螯蟹养殖水体中最丰富的门,南京克氏原螯虾和高邮罗氏沼虾水样中最丰富的是Cyanobacteria(蓝藻门),而盱眙水样中主要是Proteobacteria(变形菌门)和Actinobacteria(放线菌门)。与中华绒螯蟹相比,克氏原螯虾和罗氏沼虾养殖环境中潜在致病菌的多样性和丰度较高。三种甲壳类动物养殖环境中的主要ARGs类型均是杆菌肽、多重耐药、M-L-S(大环内酯-林可酰胺-链霉菌素)和磺胺类,bac A是主要的抗性基因亚型。除GY3外,各采样点磺胺类抗生素的浓度与磺胺类ARGs的相对丰度呈正相关(P<0.05)。线性回归分析表明中华绒螯蟹养殖环境中ARGs的相对丰度与MGEs(特别是质粒)水平呈正相关(P<0.001),罗氏沼虾养殖环境中ARGs和整合子的相对丰度正相关(P<0.05)。结果说明与国内外其他养殖环境相比,江苏甲壳类水产养殖环境中抗生素和ARGs污染水平较低,细菌多样性较高。抗生素在水产养殖环境中的暴露会抑制细菌的生长繁殖,磺胺类抗生素的残留与磺胺类ARGs的产生和传播息息相关,水平基因转移有助于ARGs在水产养殖环境中的富集。