小麦籽粒形状主效QTL定位分析

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小麦(Triticum aestivum L.)是世界上种植最广泛的作物之一,是世界饮食的主要贡献者,在粮食作物生产中占有重要的地位。小麦籽粒相关性状如千粒重、粒长、粒宽、籽粒长宽比、籽粒面积和籽粒周长都是小麦产量的重要指标。了解小麦籽粒性状的遗传特性对于小麦育种理论和实践都有重要意义。通过构建分子遗传图谱确定控制小麦籽粒相关性状的QTL在染色体的位置及遗传效应对于小麦育种工作有重要作用。本研究以本实验室创制的小麦品种大粒饱和BYL8为亲本杂交构建含有548个家系的F7、F8代RIL群体为实验材料,利用SSR标记构建遗传连锁图谱,并对与小麦籽粒相关的6个性状进行QTL定位,此外还将BSA和小麦660K SNP芯片相结合,分析控制小麦籽粒长宽比性状的主效QTL。主要结论如下:(1)在2年3点4个环境下对小麦RIL群体和其亲本的粒长、粒宽、籽粒长宽比、籽粒面积、籽粒周长和千粒重六个性状进行测定。测定结果表明:RIL群体的籽粒性状在不同环境下存在差异,表明小麦籽粒相关性状易受环境影响;偏度系数和峰度系数均小于1,结合表型分布可得出性状符合正态分布;且在多个环境下群体均有表现超亲分离。千粒重与其他五种籽粒性状显著相关,与粒长、粒宽、籽粒面积和籽粒周长呈显著正相关,与籽粒长宽比呈显著负相关。(2)构建的连锁图谱由172对在双亲中具有多态性的SSR标记组成,覆盖4285.8cM。平均每个位点间的距离为24.9cM。就单条染色体而言,染色体4D上具有较少数量的SSR标记(3个)且遗传图谱长度是最短的(37.05cM),染色体3B具有最高数量的SSR标记(17个)且遗传图谱的长度是最长的(510.81cM)。(3)利用172个SSR标记构建遗传连锁图谱,采用复合区间(CIM)作图法定位小麦籽粒相关性状QTL位点。共检测到31个QTL位于11条小麦染色体,包括1A、2A、2B、2D、3D、4B、4D、5A、5B、7A和7D,在不同环境中的单个QTL解释了1.32-15.29%的表型变异。在检测到的QTL中,控制籽粒长宽比的QTL有9个,控制籽粒面积的有7个,控制粒长的有5个,控制籽粒周长的有5个,控制粒宽的有4个,控制千粒重的有1个。(4)在小麦中经常可以在相同的标记区间发现控制不同籽粒相关性状的QTL,这可能是由于单个基因或一组紧密连锁的基因的多效性引起的。在本研究中共有7个区域同时控制两个或两个以上的籽粒性状,形成QTL簇。位于染色体2A,2B,2D,4B,5A,5B和7D上。证明了籽粒性状之间在QTL水平上存在显著的相关性。(5)通过660K芯片的方法进一步确定和缩小了2A染色体中控制籽粒长宽比的主效QTL的位置和区间,其物理位置为751004612-779844131bp,跨越28.8Mb。
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