变形杆菌(Proteus)是革兰氏阴性细菌,属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae)。它在自然界分布极广,是一种条件致病菌,能引起如食物中毒、尿路感染、夏季腹泻或其他混合感染等疾病。　　 对于变形杆菌,目前只有O10进行了全基因组测序,其O抗原基因簇的研究还处于空白阶段。本实验室前期通过限制性酶切片段长度多态性分析,证明变形杆菌的O抗原基因簇位于cpxA基因和secB基因之间。在此基础上,本论文完成了变形杆菌05、034、041、048和049这五种血清型O抗原基因簇的测序和分析。首先通过位于cpxA基因和secB基因内的引物进行长PCR扩增,然后利用该PCR产物构建shotgun文库,筛选阳性克隆进行序列测定,在获得完整序列的基础上,进行生物信息学分析,预测基因功能。　　 对这五株变形杆菌的O抗原基因簇分析后,我们发现:cpxA基因和secB基因之间的基因,多数转录方向为5’-3’,个别基因由3’-5’方向转录；O抗原基因簇的(G+C)含量在24％-28％之间,相对其基因组的(G+C)含量偏低；含有单糖合成酶基因、寡糖单位处理酶基因和糖基转移酶基因；O抗原合成均为典型的Wzy-依赖型合成途径；基因簇中多含有负责UDP-D-GlcA或UDP-D-GalA合成的基因,与其O抗原结构中多含有UDP-D-GlcA或UDP-D-GalA相符；与大肠杆菌相比,罕见单糖合成基因和糖基转移酶基因并非均位于该区域内,而该区域内的一些基因也并非O抗原合成所需,因此推测,该区域的部分基因可能负责其他寡糖成分的合成。由于wzx和wzy在其他细菌中(如大肠杆菌)常常被作为O抗原血清型的特异基因,因此,本研究分别在四株变形杆菌wzx、wzy基因内的不同位置,各设计两对引物,以79株变形杆菌(包含68种血清型)的基因组为模板进行PCR扩增,结果显示,wzx、wzy为变形杆菌O抗原血清型的特异基因,并确定所设计引物可以作为对应血清型的特异分子标识。