豇豆为豆科豇豆属(rigna unguiculata L. Walp.)一年生草本植物,广泛分布于热带及亚热带地区。其豆英可作为蔬菜,籽粒含有丰富的蛋白质(23-25%)及碳水化合物f50-67%)可作为主食。另外豇豆还是十分高效的固氮植物,对改善种植区土地肥力有着重要的作用。栽培豇豆种植历史悠久,被认为在公元前1000年左右由野生豇豆驯化而成,最初作为粮食和饲料作物广泛种植于非洲。传入亚洲后由于当地湿润的气候条件,演化出长英豇豆和短英豇豆两个亚种,成为东南亚地区重要的菜用作物。经过选育的栽培豇豆,现今已成为热带及亚热带地区农业系统中重要的组成部分。位于尼日利亚的国际热带农业研究所(International Institute for Tropical Agriculture, IITA; http://old.iita.org)和美国农业部(United States Department of Agriculture, USDA)收集了大量的豇豆资源,为豇豆遗传、育种等相关研究提供了丰富的材料。本文利用美国农业部收集的716份种质资源(其中502份核心种质)及52份美国商业品种,从表型和基因型两个方面对其遗传多样性进行了较为全面的研究。同时,对结英数、结英位置、英长、株高、株型、百粒重、藤蔓习性和生育期等性状进行全基因组关联分析。主要研究结果如下：1、参照美国农业部标准对768份豇豆资源的17个农艺性状进行了遗传多态性分析。结果显示：整个群体中以白色豆荚和白色、棕眼、光滑、半圆籽粒为主；株叶形态以直立、半蔓生株型及半戟型叶片为主。方差分析显示除粒型、结英位置、株型及结英习性在各群体间没有显著差异外,其余性状在各地理群体间显示出一定程度的差异。聚类分析可以在一定程度上区别各地理群,但各地区间(分类界限)不明显。在各群体中,商业栽培品种与其他各地区品种表型区别明显,结英数和百粒重在各群体中最高,同时变异系数和遗传多样性最低；非洲和亚洲地区资源遗传多样性最高且遗传关系较近；而北美与拉丁美洲地区间群体表型无明显差异,二者与中亚及南亚次大陆地区群体关系更近。因些,推断栽培豇豆由非洲地区起源后,进入亚洲经历了第二次驯化,而后通过殖民扩张进入美洲地区。2、利用GBS (Genotyping by Sequencing)方法从供试群体中获得的1048个高效SNP标记对群体遗传多样性、群体结构及系统聚类进行分析。遗传多样性显示,东非、西非地区以及南亚次大陆地区的种质遗传多样性最为丰富,东亚、中亚、欧洲及北美商业品种多样性较低。方差分析表明,各群体间基因变异绝大多数来自于群体内部(90%),而非群体之间(10%)。聚类分析和各地理群体遗传距离表明,美洲、南亚次大陆以及非洲东南部的群体遗传关系较近；东亚、中亚及欧洲的群体遗传关系较近；而北美商业品种与西非地区的群体虽在表型有一定差异,但基因型一致性较高。该结果再次验证,栽培豇豆应发源于西非或东非,后传入南亚次大陆经历第二次驯化,而北美商业品种可能在育种过程中大量引入了西非当地资源。3、选取8个较为重要的农艺性状：结英数、结英位置、英长、株高、株型、百粒重、藤蔓习性和生育期,使用1048个SNP标记、768份豇豆资源对其进行关联作图。在四种线性模型下,scaffold22616和scaffold8664附近位点与生育期显著相关；C35010719附近位点与株高显著相关：C35084948和scaffold72837附近位点与英长显著相关；scaffold20520附近位点与结英数显著相关；C35004001,C35022001,scaffold26894及scaffold95778附近位点与百粒重显著相关。这些标记的开发有利于完善关联分析在豇豆上的应用,同时对未来豇豆的基因辅助育种提供了参考。