两种麻蜥线粒体DNA序列变异及其在种群进化研究中的应用

来源 :杭州师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhuzhongbao2005
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为了探讨丽斑麻蜥(Eremias argus)和山地麻蜥(E. brenchleyi)种群的遗传结构与地理分布的关系,作者对两种麻蜥的线粒体细胞色素b基因(cyt b)和ND4基因序列的核苷酸变异进行了分析。用于研究的丽斑麻蜥分别采自安徽滁州(CZ)、陕西长安(CA)、河南济源(JY)、青海共和(GH)、河北邯郸(HD)、山西阳泉(YQ)、内蒙古鄂托克旗(ETK)、内蒙古兴和(XH)以及黑龙江哈尔滨(HRB),共9个地理种群;山地麻蜥分别采自于江苏徐州(XZ)、河南济源(JY)、山东泰山(TS)、河北邯郸(HD)和山西阳泉(YQ),共5个地理种群。利用PCR技术,用Clustal X(1.832)软件对丽斑麻蜥种群的线粒体DNA cyt b、ND4和山地麻蜥种群的线粒体DNA cyt b的序列进行同源序列比对与分析,为两种麻蜥的遗传多样性提供了科学理论数据。实验结果如下:  1、所分析的101个丽斑麻蜥样本cyt b部分序列长度是1045bp。A+T碱基含量较高,平均为55.5%,共检测到135个变异位点,占分析位点数的12.9%,52个单元型,在135个变异位点中,发生转换突变的位点有116个,颠换突变位点12个,既有碱基转换又有碱基颠换的位点有7个。9个种群单元型多样性(Hd)为0.45455至0.96429,核苷酸多样性(π)为0.00066至0.01732。其中,济源种群、共和种群、鄂托克种群和兴和种群的核苷酸多样性(π)较低,分别为0.00452、0.00066、0.00907和0.00547。而滁州种群、长安种群、邯郸种群、阳泉种群和哈尔滨种群的核苷酸多样性(π)很高,分别为0.01732、0.01616、0.01384、0.01450和0.01183。Fst值是0.597,基因流Nm的值是0.17。根据单元型构建了9个丽斑麻蜥种群的NJ、ML和MP分子系统树。系统发生树和种群遗传结构分析表明,9个丽斑麻蜥种群未表现出明显的系统地理格局。  2、对丽斑麻蜥9个不同种群的84个个体的ND4基因片断进行分析,所分析的序列长度是801bp。A+T碱基含量较高,平均为57.6%,共检测到103个变异位点,占分析位点数的12.9%,36个单元型,在103个变异位点中,发生转换突变的位点有86个,颠换突变位点14个,既有碱基转换又有碱基颠换的位点有3个。9个种群单元型多样性(Hd)为0.54545至1.0000,核苷酸多样性(π)为0.00068至0.01645。其中,共和种群、阳泉种群、鄂托克种群和兴和种群的核苷酸多样性(π)较低,分别为0.00068、0.00742、0.00200和0.00377。而滁州种群、长安种群、济源种群、邯郸种群和哈尔滨种群的核苷酸多样性(π)很高,分别为0.01415、0.01626、0.01001、0.01645和0.01413。Fst值是0.613,基因流Nm的值是0.16。根据单元型构建了9个丽斑麻蜥种群的NJ、ML和MP分子系统树。系统发生树和种群遗传结构分析表明,9个丽斑麻蜥种群未表现出明显的系统地理格局。  3、对山地麻蜥5个不同种群的45个个体的cyt b基因片断进行分析,所分析的序列长度是1043bp。A+T碱基含量较高,平均为53.5%,共检测到835个保守位点,208个变异位点,占分析位点数的19.9%,27个单元型。在208个变异位点中,发生转换突变的位点有163个,颠换突变位点36个,既有碱基转换又有碱基颠换的位点有9个。5个种群单元型多样性(Hd)为0.18182至1.0000,核苷酸多样性(π)为0.00017至0.01366。其中,邯郸种群、济源种群、阳泉种群和徐州种群的核苷酸多样性(π)较低,分别为0.00902、0.00017、0.00669和0.00665。而泰山种群的核苷酸多样性(π)很高,为0.01366。Fst值是0.915,基因流Nm的值是0.02。并根据单元型构建了5个山地麻蜥种群的NJ、ML和MP分子系统树。系统发生树和种群遗传结构分析表明,山地麻蜥表现出明显的系统地理格局。
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