联合抑制消减杂交及基因芯片技术筛选肿瘤转移效应基因

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bassjhnn
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景和目的肿瘤转移是一个多因素,多步骤的生物化学过程,转移表型的获得与多种转移效应基因的表达改变密切相关,因此,寻找新的转移效应基因对于深入研究肿瘤转移的分子生物学机制,及寻找新的治疗靶点都意义重大。目前,各种差异基因筛选技术在寻找转移效应基因中运用广泛,其中,抑制性消减杂交是Diatchenko等1996年提出的一种较成熟的筛选差异表达基因技术,具有操作简便、灵敏度高、假阳性率低、可有效分离低丰度差异表达基因等优点。但是,在通过SSH获得较为全面的差异产物的同时,仍然有少数表达相似的基因未被消减而保留下来,且SSH只能筛选出表达差异基因,却不能量化其表达差异,这些都给后期的分析工作造成一定困难。基因芯片能够同时检测大量基因的表达,将其用于消减文库的分析能够简化文库的后期分析工作。本实验中,我们将前期建立的前列腺癌细胞株PC3M-1E8和PC3M-2B4的消减杂交文库序列制作成基因芯片,与PC3M-1E8和PC3M-2B4的cDNA进行杂交,从中进一步筛选出表达差异较大的基因,测序及功能验证。从中选出annexinII初步研究了其与前列腺癌转移的关系。还对前期在卵巢癌基因芯片中发现的CXCL14的功能及机制进行了探讨。方法1.将前期建立的前列腺癌细胞株PC3M-1E8和PC3M-2B4消减杂交文库制备成基因芯片,与PC3M-1E8和PC3M-2B4的cDNA进行杂交,并对杂交信号进行分析。2.选取基因芯片中发现的表达差异显著的序列进行测序,并在GeneBank中进行同源性分析。3.利用RT-PCR验证annexinII在不同转移潜能的配对肿瘤细胞中的表达水平;实时定量PCR检测annexinII在临床前列腺癌标本中的表达水平,及与肿瘤转移的关系。4.基因工程技术构建CXCL14真核表达载体,转染SKOV3细胞,筛选出稳定表达CXCL14的克隆SKOV3/CXCL14。应用单层伤口愈合实验,CFSE,软琼脂克隆实验等方法研究外源性过表达CXCL14对SKOV3细胞增殖,迁移能力的影响。实验结果1.基因芯片验证共有56个序列在PC3M-1E8和PC3M-2B4中的表达差异大于两倍,测序及同源性分析其中包括17个已知基因及2条未知EST。2.annexinII在低转移肿瘤细胞株高表达,在高转移株中低表达,在前列腺癌中表达下调,且与Gleason评分具有相关性。4.成功构建了真核表达载体pcDNA3.1/CXCL14,筛选出稳定表达的克隆。单层伤口愈合实验,CFSE,软琼脂克隆实验证实外源性表达CXCL14的SKOV3细胞迁移及增殖能力均减弱。结论应用抑制性消减杂交技术成功构建了PC3M-1E8和PC3M-2B4的双向消减杂交文库,通过DNA芯片技术进一步验证文库中序列,选取部分表达差异较大的序列测序,在Genebank中同源性分析,发现17条已知基因及2条未知EST。从中选取了进行了进一步的研究。验证annexinII在不同转移潜能肿瘤细胞株及临床前列腺不同标本中表达,结果显示,annexinII的异常表达与肿瘤转移密切相关.探讨CXCL14的作用机制发现,在SKOV3中过表达CXCL14可以抑制其增殖及迁移能力。
其他文献
目的探讨中药注射剂不良反应(adverse drug reactions,ADR)的特点和规律,为临床合理用药提供参考。方法采用回顾性研究方法,对中国医院数字图书馆的CHKD期刊知识库1994~2005年报道
在数据爆炸的今天,人力资源管理与大数据逐渐结合,人力资源管理已经进入新时代。新时代的人力资源管理要求企业学会并运用人力分析以获取竞争优势。
<正>目前我国正在加速推进工业化和城市化进程,大量的农村人口流入城市,城市规模逐步扩大,城市教育面临着巨大的扩张压力,乡村教育在不断地收缩、合并中缓慢前行。这一点在县
为提高药学专业实验教学质量,本文通过尝试改变现有药学专业实践教学体系,充分探讨了实验教学在素质教育中的作用。就药学人才培养中实践教学体系的构建提出设想与初步模式,并着
近几年来,海上交通不断发展,船舶机械设备作为保证船舶稳定航行的关键,也得到了广泛关注。基于此,本文针对船舶机械设备进行分析,在简单了解船舶机械设备维护保养工作存在的
目的探讨联合使用多种传统口服中药制剂,治疗心脑血管系统疾病致消化系统的药物不良反应(adgives drug reaction,ADR)与口服中药制剂数目种类的相关性分析,为临床合理使用中药制剂
<正>1962年6月号《纽约客》,开始连载蕾切尔·卡森的环保文章,迅即,在美国社会掀起轩然大波,有震惊,有恐慌,更有,因文章内容,侵犯了某些产业集团的切身利益,而给作者带来的人
中天环保产业集团成立于20世纪90年代初,是一家跨行业、多领域的企业。公司主要从事危险废弃物焚烧成套设备研发及生产、工业废弃物的收集贮运、综合利用及城市污水治理、工程
目的探索黄体酮与间苯三酚分别联合绒毛膜促性腺激素(HCG)在先兆流产治疗中的对比分析。方法收集先兆流产孕妇90例。选择黄体酮联合HCG治疗的46例为黄体酮组,选择间苯三酚联合H
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield