慢性粒细胞白血病一种新剪接体ABLΔexon7+35INS的发现及其与TKIs耐药相关性研究

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目的:酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)耐药问题在慢性粒细胞白血病(CML)患者的靶向治疗中受到越来越多的关注。本研究检测了健康人群及CML患者TKIs治疗有效组与耐药组中ABL基因剪接体ABLΔexon7和ABL35INS的表达情况,并依据融合基因断裂位点进一步设计新引物在初发CML患者中分析各剪接体在融合型(BCR/ABL)和野生型(ABL)基因中的表达差异,并对其蛋白结构进行生物学功能分析,旨在探讨ABL基因的各剪接体与TKIs耐药发生的相关性,为阐明ABL激酶区点突变以外的TKIs耐药机制提供新的思路,为开发靶向药物提供依据。方法:1.采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法结合PCR扩增产物直接测序法,在74例健康人和76例CML患者(伊马替尼治疗有效组53例及耐药组23例)中检测ABLΔexon7和ABL35INS剪接体的发生率并进行统计分析。2.依据BCR/ABL基因发生断裂融合的特点,设计新引物,在确定线性扩增循环数的前提下,以目的条带与ABL总量的灰度比值作为各剪接体的相对表达量,在25例初发CML患者中检测并分析各剪接体在融合型和野生型ABL基因中的表达是否有差异。3.对各剪接体在蛋白水平进行生物学功能预测与分析,在理论上探讨与TKIs耐药的相关性。结果:1.发现并鉴定一种新的剪接体ABLΔexon7+35INS(ABLΔexon7和ABL35INS剪接体同时存在),该剪接体在对照组,治疗有效组和耐药组检出率分别为10.8%(8例),7.5%(4例)和8.7%(2例),统计学分析无差异。并且发现该新剪接体是ABL35INS剪接体的主要存在形式,发生率达到87.5%(14/16)。2.这提示ABL35INS剪接体的发生往往会伴随外显子7的缺失,单一35bp插入的发生比例较少。3.在74例健康对照组中检测到47例表达ABLΔexon7剪接体(63.5%),8例表达ABL35INS剪接体(10.8%),在53例伊马替尼治疗有效CML患者中检出30例表达ABLΔexon7剪接体(56.6%),5例表达ABL35INS剪接体(9.4%),23例发生CML耐药的患者中12例表达ABLΔexon7剪接体(52.2%),3例表达ABL35INS剪接体(13.0%),比较以上各组结果,无统计学差异(P值均>0.05)。4.在25例初发CML患者中检测分别转录自BCR/ABL融合型和ABL野生型的ABLΔexon7+35INS、ABLΔexon7和ABL35INS三种剪接体的相对表达量,经统计分析显示均无明显差异(P值均>0.05)。5.剪接体ABLΔexon7+35INS、ABLΔexon7和ABL35INS蛋白结构功能域相似,最终可能编码了同一种蛋白质。结论:1.首次在CML患者中发现一种新的剪接体ABLΔexon7+35INS,国内外尚未见报道。ABL35INS剪接体的发生往往会伴随exon7的缺失。2.ABL各剪接体可以转录自BCR/ABL融合型中,也可以转录自ABL野生型中,二者表达无明显差异。3.剪接体ABLΔexon7+35INS、ABLΔexon7及ABL35INS可能与CML患者TKIs治疗引发的耐药无明显相关性。
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