区域地方政府合作现已成为一种解决“棘手性”跨域公共问题的重要手段和助推我国经济增长的重要引擎。进入新时代,我国区域之间的关联性和依赖性愈发增强,加快推进区域协调发展是我国目前的重大发展战略之一。位于苏鲁豫皖四省交界带的淮海经济区作为我国成立较早的自发性区域合作组织,区域总体的综合发展水平相对较弱。2018年,《淮河生态经济带发展规划》获得批复,明确了淮海经济区作为中北部的发展重点,迎来了新的发展机遇与挑战。新的历史时期,在区域经济一体化趋势加强,公共问题的空间性、整体性和复杂性交错发展等背景下,淮海经济区地方政府间应该如何打破行政壁垒,建立真正的伙伴关系,推动区域进一步发展是目前亟需解决的问题,成为区域府际合作面临的新挑战。以整体性治理理论和协同治理理论为研究基础,具体分析了整体性治理理论的产生背景、核心要义,认为整体性治理理论与府际合作问题在价值取向、治理结构、运行机制上具有一定的契合性,为后续分析淮海经济区府际合作的困境与对策提供了理论依据。运用文献分析法对淮海经济区府际合作的现状进行研究,发现地理位置、经济发展、产业基础几个主要因素在不同程度上对淮海经济区区域合作有所影响与限制。从区域不同时期的发展特点及签订的相关协议来看,区域的发展历程大致经历了省际政府合作萌芽时期（1979—1986）、横向联合发展时期（1986—2010）、一体化建设时期（2010—2018）,协同发展时期（2018—至今）。而在2018年之后,进入协同发展时期的淮海经济区取得了较大的发展成效,包括不断完善合作机制、逐步扩大合作领域、提高区域一体化发展水平。但区域府际合作过程中仍存在一些碎片化问题。在“碎片化权威模型”的基础之上从合作认知与理念、资源与权力分配结构、政策制定与执行三个维度分析淮海经济区府际合作的碎片化问题,并从认知、环境、体制、行为、技术五个方面分析碎片化问题产生的原因。最后,运用比较研究法选取国内外具有一定借鉴意义的区域,分析其具体合作经验并结合现实情况提出了淮海经济区府际合作整体性治理的优化路径,提出通过树立整体性治理理念;建立多层次协调管理机构并发挥多元主体的力量;完善淮海经济区府际合作的保障机制;优化区域合作的技术水平,整合信息资源、建立资源共享平台来构建淮海经济区府际合作的整体性战略。