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本研究对长鳍鲤(C. carpio var. longfin)、锦鲤（koi carp）及其正反交子代之间的遗传差异做了研究。首先对这四种鱼的可数性状与可量性状做出测量，通过对这些数据的统计，分析它们之间的形态性状差异；采用传统空气干燥方法，提取四种鱼的染色体，得到它们的染色体中期分裂图像，分析其核型组成，分析亲本与子代之间染色体核型组成差异；利用特异引物，扩增5SrDNA重复序列，分析亲本与子代之间的序列差异。本研究的内容包括：1、长鳍鲤、锦鲤及子代形态差异分析测量传统可数性状（7项）和传统可量性状（12项），设置身体框架，在框架上取点测量框架数据（19项）。首先通过方差分析对测量数据进行标准化，消除鱼不同规格对数据的影响，再用主成分分析（Principal Component Analysis）、聚类分析（cluster analysis）、判别分析（discriminant analysis）等多元统计方法，对长鳍鲤（C.carpio var. longfin），锦鲤（Koi carp）及其正反交F1(长鳍鲤♀×锦鲤♂，锦鲤♀×长鳍鲤♂)的形态特征差异进行分析。结果表明：长鳍鲤、锦鲤及正反交子代的可数性状中背鳍、胸鳍、腹鳍、臀鳍、侧线上鳞、侧线鳞、侧线下鳞基本一致，各项差异不显著。主成分分析的6个主要组成成分，累积贡献率为75.038%。聚类分析结果可知正交子代的形态与母本长鳍鲤较为接近，反交子代介于母本和父本之间。用逐步判别法建立了4种鱼的判别函数，得到的判别准确率分别为86.2%～100%(P1)、86.2%～96.8%(P2)，综合判别率为93.3%。2、长鳍鲤、锦鲤及子代核型分析取长鳍鲤、锦鲤及杂交子代的头肾，采用PHA秋水仙素体内腹腔注射，空气干燥法制作头肾染色体标本，结果显示四种鱼的染色体数目均为2n=100，但是核型略有差异。长鳍鲤的染色体核型为2n=20m+24sm+56stt，臂数（NF）为144；锦鲤的染色体核型为2n=22m+30sm+48stt，臂数（NF）为152；正交子代的染色体核型为2n=22m+26sm+52stt，臂数（NF）为148；反交子代的染色体核型为2n=22m+26sm+52stt，NF=148。正反交子代的核型一致，但是与两亲本不同，介于亲本染色体核型之间，推测杂交子代不是雄核发育，也不是雌核发育，很可能是两亲本之间配子的杂合体。3、长鳍鲤、锦鲤及子代5SrDNA结构差异分析我们通过采集鳍条，设计特异引物，扩增提取长鳍鲤、锦鲤及正反交子代的5s rDNA，进行序列分析。结果表明：长鳍鲤、锦鲤及杂交子代只有一种5s rDNA结构单元（203bp），亲本间编码区高度保守，而非转录间隔区碱基变异明显；正反交子代非转录间隔区-41、-53、-55位置的碱基与锦鲤亲本的碱基一致，分别是鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)；正反交子代-4位置碱基与长鳍鲤亲本的碱基一致，为胞嘧啶(C)；杂交子代与长鳍鲤，锦鲤5s rDNA的同源性分别为96.4%和98.8%。