极端环境土壤中拮抗性链霉菌的分离筛选及其代谢产物的初步研究

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链霉菌是一类广泛存在于自然界中的革兰氏阳性丝状细菌,能产生酶、抗肿瘤制剂、免疫抑制剂、维生素和抗生素等代谢产物,尤其可以产生各种的抗生素,如放线菌素、红霉素、阿洛氨菌素及尼克霉素等。当今,由于抗生素滥用导致的病原菌抗生素耐药性,迫切要求我们开发新的抗生素。因而从极端环境或一些未开发过的环境中分离链霉菌,是获得新抗生素的重要途径,同时也是链霉菌研究的一个热点。本研究以采自河西走廊中部荒漠、青藏高原的扎加藏布、格尔木、措那湖和乌丽等原生态区域中的土壤为样品,对其中的链霉菌进行了分离培养,运用16S rRNA基因序列鉴定及分析,进行抗菌活性测定,并对分离的1株菌5-1-3进行固态发酵及产物与结构鉴定,取得如下结果。  1、从6个样点的土壤样品中共分离到了164链霉菌。其中,运用传统链霉菌分离方法,从河西走廊荒漠芦苇根际土壤中分离到了113株链霉菌相似菌株,非根际土壤中分离到了30株。表明河西走廊荒漠芦苇根际及非根际土壤样品中存在着大量的链霉菌资源,涵盖了链霉菌属的白孢类群、烬灰类群、灰红紫类群、粉红孢类群、球孢类群、黄色类群、吸水类群、青色类群、淡紫灰类群等9个类群。其中,根际土壤中的链霉菌以白孢类群、淡紫灰类群、黄色类群、灰红紫类群为主,而非根际土壤中的则以白孢类群和黄色类群为主。采用E.coli BTH101拮抗性菌株筛选方法,从青藏高原土壤中共分离到了21株E.coli BTH101拮抗链霉菌相似菌株,以黄色类群、灰红紫类群和青色类群为主,并且大部分的菌株在后期能产生不同颜色的可溶性色素。  2、选择其中的52株链霉菌进行16S rRNA基因序列PCR扩增及测序,测序结果经NCBI中的Blast比对,其中50株序列与链霉菌相似性均在99~100%之间,表明其全部为链霉菌。16S rRNA基因序列分析表明河西走廊荒漠芦苇根际及非根际土壤中存在着链霉菌,并以浅天蓝链霉菌(S.coerulescens)、变异链霉菌(S.variabilis)和天蓝褐链霉菌(S.coeruleofuscus)为优势菌群。青藏高原土壤中的10株菌分别属于链霉菌的不同种。  3、以细菌枯草芽孢杆菌(B.subtilis)、金黄色葡萄球菌(S.aureus)、大肠杆菌(E.coli)和E.coli BTH101,真菌辣椒晚疫病菌(P.capsici)、甘蓝枯萎菌(F.oxysporum sp.conglutinans)和番茄灰霉菌(B.cinerea)为测试菌株,共从这6个样点中分离到了134株抗细菌链霉菌,33株抗真菌链霉菌株。从河西走廊荒漠芦苇根际及非根际土壤中分离了112株拮抗链霉菌,其中98株对B.subtilis、S.aureus和E.coli有拮抗性,仅8株对E.coli BTH101具有拮抗性,33株对P.capsici、F.oxysporum和B. cinerea有拮抗性。从青藏高原土壤样品中共分离筛选出了21株对E.coli BTH101有拮抗作用的链霉菌。总体结果表明,在该研究的极端环境土壤中具有较丰富的拮抗性链霉菌资源,具有进一步挖掘的价值。  4、对分离纯化的抗 E.coli BTH101菌株进行了抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)试验,从中分离出菌株5-1-3和EJZB3-1具有较强的MRSA抗性。对菌株5-1-3进行固态发酵,对发酵产物进行了分离纯化,经有机溶剂萃取、多次柱层析及高效液相色谱分离分析,从发酵产物中分离到多种次生代谢产物,对其中1种具有较强S.aureus、MRSA抗生作用的淡黄色化合物进行了核磁分析,确定其为棘霉素,产率为20mg/L。其它的代谢产物正在进行进一步分析,有望获得新的抗生素。
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